The eukaryotic linear motif resource - 2018 update.
The eukaryotic linear motif resource - 2018 update.
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DOI：
10.1093/nar/gkx1077
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发表时间：
2018-01-04
影响因子：
14.9
通讯作者：
Gibson TJ
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Gouw M;Michael S;Sámano-Sánchez H;Kumar M;Zeke A;Lang B;Bely B;Chemes LB;Davey NE;Deng Z;Diella F;Gürth CM;Huber AK;Kleinsorg S;Schlegel LS;Palopoli N;Roey KV;Altenberg B;Reményi A;Dinkel H;Gibson TJ
短线性基序（SLiM）是蛋白质结合模块，在几乎所有的细胞过程中发挥重要作用。SLiM很短，通常高度简并，难以表征且难以检测。真核线性基序（ELM）资源（elm.eu.org）致力于SLiM，包括超过275个基序类别和超过3000个基序实例的手动管理数据库，以及发现蛋白质序列中候选SLiM的管道。15年来，ELM一直是模体研究的主要资源之一。在本次数据库更新中，我们向数据库提供了最新的补充，包括32个新的基序类，以及包括Uniprot和Reactome集成在内的新功能。最后，为了帮助提供细胞背景，我们提出了一些关于细胞周期中SLiM的生物学见解，作为细菌致病性及其在人类激酶组中的功能的靶点。
Short linear motifs (SLiMs) are protein binding modules that play major roles in almost all cellular processes. SLiMs are short, often highly degenerate, difficult to characterize and hard to detect. The eukaryotic linear motif (ELM) resource (elm.eu.org) is dedicated to SLiMs, consisting of a manually curated database of over 275 motif classes and over 3000 motif instances, and a pipeline to discover candidate SLiMs in protein sequences. For 15 years, ELM has been one of the major resources for motif research. In this database update, we present the latest additions to the database including 32 new motif classes, and new features including Uniprot and Reactome integration. Finally, to help provide cellular context, we present some biological insights about SLiMs in the cell cycle, as targets for bacterial pathogenicity and their functionality in the human kinome.
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影响因子：
14.9
作者：
Letunic I;Doerks T;Bork P
通讯作者：
Bork P
影响因子：
5.8
作者：
Dosztányi, Z;Csizmok, V;Simon, I
通讯作者：
Simon, I
影响因子：
14.9
作者：
Dinkel H;Van Roey K;Michael S;Kumar M;Uyar B;Altenberg B;Milchevskaya V;Schneider M;Kühn H;Behrendt A;Dahl SL;Damerell V;Diebel S;Kalman S;Klein S;Knudsen AC;Mäder C;Merrill S;Staudt A;Thiel V;Welti L;Davey NE;Diella F;Gibson TJ
通讯作者：
Gibson TJ
影响因子：
--
作者：
Davey, Norman E.;Van Roey, Kim;Gibson, Toby J.
通讯作者：
Gibson, Toby J.
影响因子：
14.9
作者：
Dinkel H;Van Roey K;Michael S;Davey NE;Weatheritt RJ;Born D;Speck T;Krüger D;Grebnev G;Kuban M;Strumillo M;Uyar B;Budd A;Altenberg B;Seiler M;Chemes LB;Glavina J;Sánchez IE;Diella F;Gibson TJ
通讯作者：
Gibson TJ