Analysis of pentatricopeptide repeat proteins in vivo: target RNAs and functions

RNA结合蛋白调节基因表达的中心过程，并在Vielzellern的Wachstum和Entwicklung中起重要作用。Pflanzen的核心是RNA结合蛋白，在线粒体和叶绿体中有数百个重要的韦尔登。努尔认为，在体内韦尔登实验中，这些基因具有独特的沃登和功能。因此，PPR家族中的五肽重复序列（PPR）家族是一个非常重要的RNA结合蛋白家族，在生理学上与RNA配体的识别有关，沃登。在本项目中，我们将研究一种PPR蛋白的体外表达，并在体内检测相关的Ziel-RNA。韦尔登PPR蛋白质来源于其天然的同源性免疫印迹，并通过微阵列杂交鉴定其特异性RNA。平行的韦尔登使PPR蛋白的功能与Ziel-RNA的代谢功能完全相同。

RNA Bindeproteine regulieren zentrale Prozesse der Genexpression und sind somit von eminenter Bedeutung für Wachstum und Entwicklung von Vielzellern. Das Kerngenom von Pflanzen kodiert eine Vielzahl von RNA Bindeproteinen, von denen wiederum einige hundert in die Mitochondrien und Chloroplasten importiert werden. Nur wenige davon sind charakterisiert worden und nur in seltenen Ausnahmen konnten dabei Substrat-RNAs und Funktion in vivo bestimmt werden. So ist für die größte Familie von putativen RNA Bindeproteinen in Pflanzen, die pentatricopeptid repeat (PPR) Familie, in keinem Fall der spezifische, physiologisch relevante RNA Ligand identifiziert worden. In diesem Projekt wird versucht von einer Auswahl von PPR Proteine die in vivo relevanten Ziel-RNAs zu bestimmen. Dazu werden PPR Proteine aus ihrem nativen Kontext immunopräzipitiert und die aus dem Präzipitat isolierten RNAs mittels microarray-Hybridisierung identifiziert. Parallel werden Mutanten isoliert, um die Funktion der ausgewählten PPR Proteine für den Metabolismus der jeweiligen Ziel-RNA zu bestimmen.