Integrierte genomische und proteomische Untersuchungen klinischer Gewebeproben
Integrierte genomische und proteomische Untersuchungen klinischer Gewebeproben
批准号:
167388777
负责人:
Dr. Katharina Malinowsky
金额:
$0.0万
依托单位国家:
德国
项目类别:
Research Grants
财政年份:
2010
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
2009-12-31 至 2012-12-31
中文摘要
组织病理学和分子生物学研究表明,在Hinblick中,Zahl的组织病理学和分子生物学研究仍然是一种治疗方法。Dabei spielen Untersuchungen auf genomischer und proteomischer Ebene eine Malinowsky / Genom und Proteom aus FFPE Gewebe herausragende Rolle. Derzeit韦尔登klinische Gewebebebebeben(z.B.福尔马林固定剂(Formalin-fixiertes Gewebe)可用于DNA、RNA和蛋白质的检测,并可用于治疗后的分子结构分析或鉴定。在我们的工作中,我们需要一种稳定和可靠的方法,通过在Lösung进行韦尔登固定的免疫反应性蛋白质的收集和定量。Kürzlich是我们的共同点,在一个Schritt-Verfahren不是单纯的蛋白质,因此,DNA,RNA和miRNA也可以通过福尔马林固定的Gewebebebroben来分离。Das Ziel meines Projektes is the Optimierung and estmalige Anwendung dieses neuartigen ein-Schritt-Verfahren zur Untersuchung klinischer Gewebebebroben am Beispiel of uPA/派-1 Systems beimmakarzinom. Folgendes Vorgehen ist geplant:1.优化方法(平行提取miRNA和蛋白质)和检测方法; 2. Anwendung des Verfahrens an 100 Mammakarzinomen; 3.功能性研究miRNA对uPA-和派-1-表达的调控。我的项目首先在福尔马林固定的实验中进行了定量的miRNA和蛋白质检测。在Zukunft中,基因组学和蛋白质组学将在临床上并行研究,肿瘤生物学将更好地进行研究和有效的治疗。
英文摘要
Die histopathologische und molekulare Untersuchung klinischer Gewebeproben wird im Hinblick auf die stetig steigende Zahl zielgerichteter Therapien immer bedeutsamer. Dabei spielen Untersuchungen auf genomischer und proteomischer Ebene eine Malinowsky / Genom und Proteom aus FFPE Gewebe herausragende Rolle. Derzeit werden klinische Gewebeproben (z.B. Formalin-fixiertes Gewebe) jedoch getrennt auf DNA-, RNA- und Proteinebene untersucht, um molekulare Zielstrukturen für therapeutische Ansätze nachzuweisen oder zu identifizieren. In unserem Labor wurde bereits ein standardisiertes und robustes Verfahren entwickelt, mit dessen Hilfe intakte, immunreaktive Proteine aus Formalin-fixierten Gewebeproben in Lösung gebracht und quantifiziert werden können. Kürzlich ist es uns gelungen, in einem ein-Schritt-Verfahren nicht nur Proteine, sondern gleichzeitig auch DNA, RNA und miRNA aus Formalin-fixierten Gewebeproben zu isolieren.Das Ziel meines Projektes ist die Optimierung und erstmalige Anwendung dieses neuartigen ein-Schritt-Verfahrens zur molekularen Untersuchung klinischer Gewebeproben am Beispiel des uPA/PAI-1 Systems beim Mammakarzinom. Folgendes Vorgehen ist geplant: 1. Optimierung der Methodik (parallele Extraktion von miRNA und Proteinen) an Testgeweben und Zelllinien; 2. Anwendung des Verfahrens an 100 Mammakarzinomen; 3. Funktionelle Untersuchungen zur miRNA-basierten Regulation der uPA- und PAI-1-Expression. Mit meinem Projekt verbinde ich erstmalig quantitative miRNA- und Proteinuntersuchungen in den gleichen Formalin-fixierten Gewebeproben. In Zukunft wird es entscheidend sein, genomische und proteomische Untersuchungen in klinischen Gewebeproben parallel durchzuführen, um die Tumorbiologie besser zu verstehen und effizientere Behandlungsmöglichkeiten zu erarbeiten.
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