Oxidative protein modifications caused by reactive oxygen and nitrogen species in cell cultures and rat models of hypoxia and nitrosative stress

近年来，酶催化后修饰（PTM）的应用越来越广泛，但酶催化后修饰并不适用于新的研究领域。该方法通过对PTM和半胱氨酸（二硫化物、硫代、亚磺酰和亚硝酰）和酪氨酸（亚硝酰和亚磷酸）进行分组，从而使蛋白质的羰基化对ROS/RNS和/或低氧的影响更大。本课题旨在建立一种新的非酶促PTM蛋白质组学、定性和定量分析技术。因此，阿勒修改一个位置（“串扰”），可以得到一个功能强大的Aspekte和对信号线韦尔登的影响。Zunächst sollen die Analysen etablert und die betroffenen Proteine in primären Zellkulturen（Herz & Kortex）für Hypoxie und/oder nitrosativen Stress identifiziert韦尔登，bevor die Analysen auf die entsprechenden Organe eines etablerten Tiermodells ausgedehnt würden.大足将有一个快速的光谱仪，用于我们建立的技术（凝胶-基础和凝胶-自由的Trenn-和Anreicherungstechniken，质谱仪），并进行transskriptomanalysen和funktionellen测试，这些测试可进行韦尔登。通过数据分析，我们可以发现，在一个韦尔登的评价中，功能和生物学意义的作用和意义是非常重要的。

In den letzten Jahrzehnten wurden durch Enzyme katalysierte posttranslationale Modifikationen (PTM) sehr ausführlich untersucht, während nicht-enzymatische PTM nur in wenigen Gruppen erforscht wurden. Dieser Antrag verfolgt das Ziel beide Gruppen von PTM an Cystein- (Disulfide, Sulfen-, Sulfin-, Sulfonsäure & Nitrosylierung) und Tyrosinresten (Nitrosylierung & Phosphorylierung), sowie die Proteincarbonylierung unter dem Einfluss erhöhter Konzentrationen an ROS/RNS und/oder Hypoxie zu analysieren. Dabei geht das Projekt über die Etablierung neuer Techniken zur Proteom-weiten, qualitativen und quantitativen Analyse der nicht-enzymatischen PTM deutlich hinaus. So soll die gegenseitige Beeinflussung aller Modifikationen an einer Position („cross-talk“), die daraus resultierenden funktionellen Aspekte und deren Einfluss auf die Signalwege untersucht werden. Zunächst sollen die Analysen etabliert und die betroffenen Proteine in primären Zellkulturen (Herz & Kortex) für Hypoxie und/oder nitrosativen Stress identifiziert werden, bevor die Analysen auf die entsprechenden Organe eines etablierten Tiermodells ausgedehnt würden. Dazu würde ein breites Spektrum bei uns etablierter Techniken (Gel-basierte & Gel-freie Trenn- & Anreicherungstechniken, Massenspektrometrie) mit Transkriptomanalysen und funktionellen Tests kombiniert werden. Mit den Daten sollen die Modifikationen systembiologisch in Abhängigkeit von verschiedenen Zellkulturbedingungen bezüglich ihres zeitlichen Verlaufs, sowie der funktionellen und biologischen Signifikanz untersucht und letztlich in einem Tiermodell evaluiert werden.