Identification of causative gene for Malignant Hyperthemia using exome sequencing
Identification of causative gene for Malignant Hyperthemia using exome sequencing
批准号:
24659704
负责人:
MATOBA Nana
金额:
$2.41万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
财政年份:
2012
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2012-04-01 至 2014-03-31
中文摘要
我们对患有恶性高热的日本家系进行了外显子组测序。该家系中携带者RYR1的所有外显子在先前的研究中都被直接测序,没有发现致病突变。为了有效地检测致病突变,我们准备了一组候选基因,其中包括1)与钙信号相关的基因,2)位于恶性高热易感区域的基因,3)在RYR1和CACNA1S高表达的组织中表达的基因,或4)直接或间接与CACNA1S或RYR1相互作用的基因。利用外显子组测序数据和候选基因集,我们鉴定了5个可能的突变。其中一个突变是编码电压门控L型钙通道阿尔法亚单位的CACNA1S。这个亚基与Ryanodine受体1相互作用。该突变是否真的是该家族的病因还有待进一步的研究,如电生理实验。
英文摘要
We performed exome sequencing of Japanese families with malignant hyperthermia. All exons of RYR1 of the carrier in this family were directly sequenced in previous research and no causative mutation has been found. To detect disease causing mutation efficiently, we prepared sets of candidate genes that contain 1) genes related to calcium signaling, 2) genes located on malignant hyperthermia susceptibility loci, 3) genes expressed in tissues where RYR1 and CACNA1S are highly expressed or 4) genes that interact with CACNA1S or RYR1 directly or indirectly. Using data from exome sequencing and the candidate gene sets, we identified 5 plausible mutations. One of the mutations was in CACNA1S that codes voltage-gated L-type calcium channel alpha subunit. This subunit interacts with Ryanodine receptor 1. The functional validation if this mutation is really causative of this family awaits further study such as an electrophysiological experiment.
期刊论文(8)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
登录
查看更多内容
Exome Sequencing identified a noel mutation in CACNA1S in a Japanese family with Malignant Hyperthermia
外显子组测序在一个患有恶性高热的日本家庭中发现了 CACNA1S 的 noel 突变
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[甲斐慎一, 田中具治, 松山智紀, 大条紘樹, 広田喜一 ,福田和彦, 広田喜一, Kiichi Hirota, 広田喜一, 広田喜一, 広田喜一, Nana MATOBA, Nana MATOBA, Nana MATOBA, Nana MATOBA, Nana Matoba, Nana Matoba, Nana Matoba]
通讯作者:
Nana Matoba
Exome sequencing identified a novel mutation in CACNA1S in a Japanese family with Malignant Hyperthermia
外显子组测序在一个患有恶性高热的日本家庭中发现了 CACNA1S 的新突变
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
--
作者:
[甲斐慎一, 田中具治, 松山智紀, 大条紘樹, 広田喜一 ,福田和彦, 広田喜一, Kiichi Hirota, 広田喜一, 広田喜一, 広田喜一, Nana MATOBA, Nana MATOBA]
通讯作者:
Nana MATOBA
Detection of a novel mutation in CACNA1S in a Japanese family
在日本家庭中检测到 CACNA1S 的新突变
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
--
作者:
[甲斐慎一, 田中具治, 松山智紀, 大条紘樹, 広田喜一 ,福田和彦, 広田喜一, Kiichi Hirota, 広田喜一, 広田喜一, 広田喜一, Nana MATOBA, Nana MATOBA, Nana MATOBA]
通讯作者:
Nana MATOBA
Identification of novel mutations in Japanese families with Malignant Hyperthermia using whole exome sequencing
使用全外显子组测序鉴定日本恶性高热家族的新突变
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
--
作者:
[甲斐慎一, 田中具治, 松山智紀, 大条紘樹, 広田喜一 ,福田和彦, 広田喜一, Kiichi Hirota, 広田喜一, 広田喜一, 広田喜一, Nana MATOBA]
通讯作者:
Nana MATOBA
Exome sequencing and family-based analysis for the identification of a mutation in a Japanese family with Malignant Hyperthermia
外显子组测序和基于家族的分析用于鉴定日本恶性高热家族中的突变
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
--
作者:
[甲斐慎一, 田中具治, 松山智紀, 大条紘樹, 広田喜一 ,福田和彦, 広田喜一, Kiichi Hirota, 広田喜一, 広田喜一, 広田喜一, Nana MATOBA, Nana MATOBA, Nana MATOBA, Nana MATOBA]
通讯作者:
Nana MATOBA
海外基金