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Genome wide protein structure and function prediction database using homology modelling

Genome wide protein structure and function prediction database using homology modelling
使用同源建模的全基因组蛋白质结构和功能预测数据库
批准号：
15013251
负责人：
UMEYAMA Hideaki
金额：
$35.84万
依托单位：
Kitasato University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2003
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2003 至 2004
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15013251/
关键词：
proteinstructurepredictionCASPCAFASPFAMSGTOPFAMSBASEゲノムホモロジーモデリングコンピュータ解析アライメントFAMS、FAMSBASEバイオインフォマティックスプロテオーム遺伝子タンパク質データベ-スタンパク質立体構造予測機能進化解析

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
利用同源建模程序FAMS建立了蛋白质结构模型数据库FAMSBASE，并建立了同源检索结果网站GTOP，它是可用的viahttp://www.pharm.kitasato-u.ac.jp/fams/http://spock.genes.nig.ac.jp/~genome/
英文摘要
Protein Structural Model database "FAMSBASE" was constructed using homology modeling program "FAMS".And homology search results web site "GTOP" was constructed.It is were available viahttp://www.pharm.kitasato-u.ac.jp/fams/http://spock.genes.nig.ac.jp/~genome/
期刊论文(50)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Protein structure prediction in CASP6 using CHIMERA and FAMS
使用 CHIMERA 和 FAMS 预测 CASP6 中的蛋白质结构
DOI： --
发表时间： 2005
期刊： Proteins (Published on line)
影响因子： --
作者： [Mayuko Takeda-Shitaka, Genki Terashi, Daisuke Takaya, Kazuhiko Kanou, Mitsuo Iwadate, Hideaki Umeyama]
通讯作者： Hideaki Umeyama
Fukami-Kobayashi K, Tateno Y, Nishikawa K: "Parallel Evolution of Ligand Specificity Between LacI/GalR Family Repressors and Periplasmic Sugar-Binding Proteins"Molecular Biology and Evolution. 20・3. 267-277 (2003)
Fukami-Kobayashi K、Tateno Y、Nishikawa K：“LacI/GalR 家族阻遏物与周质糖结合蛋白之间的配体特异性的并行进化”《分子生物学与进化》20・3。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Searching for protein-protein interaction sites and protein-protein docking by the methods of molecular dynamics, grid scoring and the pair-wise interaction potential of amino acid residues.
利用分子动力学、网格评分和氨基酸残基配对相互作用势的方法寻找蛋白质-蛋白质相互作用位点和蛋白质-蛋白质对接。
DOI： --
发表时间： 2005
期刊： Proteins 60
影响因子： --
作者： [Terashi G, Takeda-Shitaka M, Takaya D, Umeyama H]
通讯作者： Umeyama H
Evaluation of homology modeling of the severe acute respiratory syndrome (SARS) coronavirus main protease for structure based drug design
DOI： 10.1248/cpb.52.643
发表时间： 2004-05-01
期刊： CHEMICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN
影响因子： 1.7
作者： [Takeda-Shitaka, M, Nojima, H, Umeyama, H]
通讯作者： Umeyama, H
共 17 条
    Construction of Database of Rat and Mouse Genes for Three Dimensional Monomer and Complex Protein Structure
    • 批准号：
      18310139
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $3.2万
    • 财政年份：
      2006
    • 负责人：
      UMEYAMA Hideaki
    • 依托单位：
      Kitasato University
    国内基金
    海外基金
    Rh-N4位点催化醇类氧化反应的微观机制与构效关系研究
    • 批准号：
      22302208
    • 项目类别：
      青年科学基金项目
    • 资助金额：
      30.00万元
    • 批准年份：
      2023
    • 负责人：
      王翔
    • 依托单位：
      中国科学院化学研究所
    体内亚核小体图谱的绘制及其调控机制研究
    • 批准号：
      32000423
    • 项目类别：
      青年科学基金项目
    • 资助金额：
      24.0万元
    • 批准年份：
      2020
    • 负责人：
      温增麒
    • 依托单位：
      中国科学院生物物理研究所
    水稻H3K27me3标记基因的三维基因组结构解析及其调控抽穗期的机理研究
    • 批准号：
      32070612
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      58.0万元
    • 批准年份：
      2020
    • 负责人：
      李兴旺
    • 依托单位：
      华中农业大学
    稻瘟病菌中蛋白激酶MoCK2参与附着胞极性生长影响致病性的初步探索
    • 批准号：
      32060597
    • 项目类别：
      地区科学基金项目
    • 资助金额：
      35.0万元
    • 批准年份：
      2020
    • 负责人：
      张连虎
    • 依托单位：
      江西农业大学