Parametric and nonparametric linkage analysis with dense marker maps.
Parametric and nonparametric linkage analysis with dense marker maps.
批准号:
5310406
负责人:
Professor Dr. Konstantin Strauch
金额:
$0.0万
依托单位国家:
德国
项目类别:
Research Units
财政年份:
2001
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
2000-12-31 至 2007-12-31
中文摘要
《遗传流行病学》是一种新的流行病学研究方法,可用于鉴别和鉴别、诊断和诊断。从根本上来说,这是一件非常重要的事情。我们将对基因组进行扫描。他分析了这两种情况,并对他们进行了评估。它死于秋天,所以它死于染色体区域内现存的克兰克氏族。技术专家Fortschritt haben Gmeinsam dazu beigetragen,daüdie Kartierung gentisch Einfacher,也是Rezessiver Erbkrankheiten kein prinzipielle问题的主导者。Neben der Entdeckung HOCHPLICATOR MARKERSYSTEM WAR DABE DUBE DISTHER MARTHER ALM AND BUTHERNER ALTHORM AND BERFAHREN WITHER WESSENTLISHER BEDUTUNG.他说:“这是一件很重要的事情,因为这是一件很重要的事情。”在Solchen Fällen könnnen Personen terroffen sein中,我们发现了突变zu haben(sposadische Fälle oder Phänokopien),而不是Gesund sein,obwohl sie die突变tragen(unvollständige Penetranz)。这是一种遗传基因印记,也是原产父母的遗传基因印记。一个Genorten,Die DEM印记了所有的东西,而且还缠绕着Das vom Vater oder das von der Mutter geerte Allel Ganz oder teilweise deaktiviert.在我们的研究方法中,数理统计方法分析了Krankheiten-krankheiten-krankheiten weterzuentwickeln,这是一种软件实现的方法。Geants sind Nichtparametrische Methoden(等位基因共享-Verfahren)für viele Genetische Marker and komplexe Stammbäume,die das genomische印记berück sichtigen。Darüberhinaus soll ein Hilfsmittel für die sgenannte勘探者是一名分析专家,它分析了所有的数据,并自动生成了最大的模型参数。在分析和程序设计中,我们可以找到一个更好的选择和规范。这句话的意思是:“我不知道你的名字是什么意思,你的名字是什么意思?”它的实现、算法的实现,从根本上解决了这一问题,从根本上解决了这一问题。
英文摘要
Die Genetische Epidemiologie befaßt sich mit der Identifizierung und Charakterisierung von Genen, die ursächlich an der Entstehung von Krankheiten beteiligt sind. Der erste Schritt dazu ist die Genkartierung, die heute meistens genom-weit durchgeführt wird. Eine solche Durchmusterung des Genoms nennt man auch Genom-Scan. Mittels der Kopplungsanalyse wird untersucht, ob bestimmte Markerausprägungen und Krankheitsphänotypen überproportional häufig gemeinsam vererbt werden. Ist dies der Fall, so spricht dies für die Existenz eines krankheitsverursachenden Gens in der chromosomalen Region. Technologischer wie methodischer Fortschritt haben gemeinsam dazu beigetragen, daß die Kartierung genetisch einfacher, also dominanter oder rezessiver Erbkrankheiten kein prinzipielles Problem mehr darstellt. Neben der Entdeckung hochpolymorpher Markersysteme war dabei die Implementation moderner Algorithmen und biometrisch-genetischer Verfahren in Computerprogramme von wesentlicher Bedeutung. Deutlich schwieriger ist die Genkartierung bei solchen Phänotypen, die keinem einfachen Mendelschen Erbgang unterliegen, sondern bei denen die Ausprägung von Umweltfaktoren oder zusätzlichen genetischen Faktoren abhängt. In solchen Fällen können Personen betroffen sein, ohne die betreffende Mutation zu haben (sporadische Fälle oder Phänokopien), oder umgekehrt gesund sein, obwohl sie die Mutation tragen (unvollständige Penetranz). Eine Besonderheit stellt das genomische Imprinting dar, das auch als parent-of-origin-Effekt bezeichnet wird. An Genorten, die dem Imprinting unterliegen, wird entweder das vom Vater oder das von der Mutter geerbte Allel ganz oder teilweise deaktiviert. Wenn dieses ein krankheitsverursachendes Allel ist, so kommt es nicht zur Krankheitsausprägung.In diesem methodischen Projekt geht es darum, mathematisch-statistische Methoden der Kopplungsanalyse für genetisch-komplexe Krankheiten weiterzuentwickeln, methodische Entwicklungen in Software zu implementieren und schließlich diese Hilfsmittel bei der Kartierung bestimmter Krankheiten anzuwenden. Geplant sind nichtparametrische Methoden (´allele-sharing´-Verfahren) für viele genetische Marker und komplexe Stammbäume, die das genomische Imprinting berücksichtigen. Darüberhinaus soll ein Hilfsmittel für die sogenannte exploratorische Kopplungsanalyse entwickelt werden, welches automatisch modell-basierte LOD-Scores über die Parameter des Krankheitsmodells maximiert. Ein anderer wichtiger Punkt ist die Möglichkeit, geschlechtsspezifische Markerabstände in Kopplungsanalyse-Programmen zu verwenden. Diese Erweiterungen haben das Ziel, genetisch bedingte Krankheiten adäquat zu modellieren und damit die Trennschärfe der Kopplungsanalyse zu erhöhen. Die Implementation, algorithmische Verfeinerung und Anwendung der neuen Entwicklungen bietet klinisch-genetischen Projekten, sowohl im Rahmen dieser Forschergruppe als auch in anderen Gruppen, eine fundierte methodische Unterstützung für den Bereich der Kopplungsanalyse und kommt ihnen damit direkt zugute.
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会议论文
Methods and algorithms for haplotype-based linkage and association analysis of rare genetic variants
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批准号:179606676
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2010
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负责人:Professor Dr. Konstantin Strauch
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依托单位:
Development and implementation of linkage-analysis methods for the genetic mapping of complex traits
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批准号:43639535
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2007
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负责人:Professor Dr. Konstantin Strauch
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依托单位:
Linkage analysis of genetically complex diseases with genomic imprinting and two-locus trait models
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批准号:5346368
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项目类别:Publication Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2001
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负责人:Professor Dr. Konstantin Strauch
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依托单位:
国内基金
海外基金
半参数空间自回归面板模型的有效估计与应用研究
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批准号:71961011
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项目类别:地区科学基金项目
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资助金额:16.0万元
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批准年份:2019
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负责人:丁飞鹏
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依托单位: