ESTs, Microarrays und Proteomics

隐单胞菌是一种内共生进化菌，光养原生生物。在Zellkern，线粒体和质体中，隐单核细胞与核形物一起形成了一个具有多种DNA的细胞器。在一个基因组计划中，我们的核形态基因组可以进行线粒体-染色体测序;但我们可以进行质体的测序。在该研究项目中，我们对玉米种子进行了EST-Analyse Aufschlüber。EST-Daten韦尔登一般使用a）hochemite Arrays zu erstellen和B）eine Proteomanalysis zu ermöglichen。我们在这个项目中研究了Zellkerns的Kodierungskapazität，以确定Kern-kodierter PlastidenProteine的身份。Als Nebenprodukt韦尔登Kern-kodierte Proteine des eukaryoten Symbionten und die notwendigen topogenen Signale für deren intrazelluläre Verlagerung identifiziert. Die Microarray-Experimente韦尔登das Netzwerk der koordinierten Expression plastidärer Funktionen aufzeigen; dieses Wissen mündet schließlich in der Proteombestimmung des Stromas der komplexen Plastide der Cryptomonucleus.阵列技术发展中的并行高分辨率方法创新韦尔登，sog.肽阵列，也可用于蛋白质-蛋白质-相互作用的筛选。

Cryptomonaden sind in sekundärer Endosymbiose evolvierte, phototrophe Protisten. Neben dem Zellkern, den Mitochondrien und Plastiden beherbergen die Cryptomonaden mit dem Nucleomorph ein viertes DNA-haltiges Organell. In einem Genomprojekt wurden von uns das Nucleomorph-Genom sowie das Mitochondrien-Chromosom sequenziert; darüber hinaus steht die Sequenz des Plastoms zur Verfügung. In dem hier beantragten Projekt soll eine EST-Analyse Aufschluß über die Kodierungskapazität des Zellkerns geben. Die EST-Daten werden genutzt um a) hochdichte Arrays zu erstellen und b) eine Proteomanalyse zu ermöglichen. Wir erwarten in diesem Projekt die Kodierungskapazität des Zellkerns zu bestimmen sowie die Identität Kern-kodierter Plastidenproteine. Als Nebenprodukt werden Kern-kodierte Proteine des eukaryoten Symbionten und die notwendigen topogenen Signale für deren intrazelluläre Verlagerung identifiziert. Die Microarray-Experimente werden das Netzwerk der koordinierten Expression plastidärer Funktionen aufzeigen; dieses Wissen mündet schließlich in der Proteombestimmung des Stromas der komplexen Plastide der Cryptomonaden. Parallel hierzu sollen methodische Innovationen der Array-Technologie entwickelt werden, sog. Peptid-Arrays, welche ein schnelles Screenen auf Protein-Protein-Interaktionen gestatten.