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Analysis of stress-responsive non-coding antisense RNAs that are co-expressed with sense RNAs

Analysis of stress-responsive non-coding antisense RNAs that are co-expressed with sense RNAs
与有义 RNA 共表达的应激反应性非编码反义 RNA 的分析
批准号：
21570056
负责人：
SEKI Motoaki
金额：
$3.0万
依托单位：
The Institute of Physical and Chemical Research
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2009
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2009 至 2011
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21570056/
关键词：
植物ゲノムストレス発現制御非翻訳型RNAアンチセンスRNARNA-dependent RNA polymeraseRNA制御環境ストレス応答small RNAシロイヌナズナタイリングアレイ解析非翻訳性RNA

项目摘要

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中文摘要
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本研究在拟南芥中鉴定了约7000个逆境诱导反义RNA，并发现RD 29 A位点具有典型的干旱诱导基因，该位点具有一类与正义mRNA序列互补的逆境诱导反义RNA。真实的RT-PCR分析表明，RD 29 A反义RNA的积累在rdr 1/2/6三突变体中减少。我们的数据表明，RDR介导的反义RNA的合成在植物逆境条件下的正义mRNA的周转中起作用，这是一种新的RNA调节机制。
英文摘要
Our previous study identified about 7, 000 stress-inducible antisense RNAs in Arabidopsis and showed that RD29A locus that has typical drought-inducible gene, has a type of stress-inducible antisense RNA which is complementary to sequence of the sense mRNA. Real time RT-PCR analysis showed that accumulation of RD29A antisense RNA was decreased in rdr1/2/6 triple mutants. Our data indicates a novel RNA regulation mechanism that RDR-mediated synthesis of antisense RNAs functions in the turnover of sense mRNAs under the stress conditions in plants.
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会议论文
RNA-dependent RNA polymeraseにより、環境ストレス下でアンチセンスRNAが生成する
RNA依赖性RNA聚合酶在环境压力下产生反义RNA
DOI： --
发表时间： 2012
期刊：
影响因子： --
作者： [松井章浩, ら]
通讯作者： ら
A survey and analysis of regulated alternative splicing events in Arabidopsis thaliana using genome tiling array and mRNA-seq
使用基因组平铺阵列和 mRNA-seq 对拟南芥中受调控的选择性剪接事件进行调查和分析
DOI： --
发表时间： 2011
期刊：
影响因子： --
作者： [Iida, K., Kawaguchi, S., Harada, E., Matsui, A., Seki, M. and Toyoda, T.]
通讯作者： T.
ARTADE2DB: Improved Statistical Inferences for Arabidopsis Gene Functions and Structure Predictions by Dynamic Structure-Based Dynamic Expression (DSDE) Analyses
DOI： 10.1093/pcp/pcq202
发表时间： 2011-02-01
期刊： PLANT AND CELL PHYSIOLOGY
影响因子： 4.9
作者： [Iida, Kei, Kawaguchi, Shuji, Toyoda, Tetsuro]
通讯作者： Toyoda, Tetsuro
Functional genomics using RIKEN Arabidopsis thaliana Full-Length(RAFL)cDNAs
使用 RIKEN 拟南芥全长 (RAFL)cDNA 进行功能基因组学
DOI： --
发表时间： 2009
期刊： J.Plant Res. 122
影响因子： --
作者： [Seki, M.]
通讯作者： M.
共 26 条
    Identification of novel siRNA pathways involved in plant environmental stress responses
    • 批准号：
      24657041
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • 资助金额：
      $2.58万
    • 财政年份：
      2012
    • 负责人：
      SEKI Motoaki
    • 依托单位：
      Institute of Physical and Chemical Research
    海外基金