课题基金 / 基金详情

Analysis of SNPs that induce structural change of RNA secondary structures

Analysis of SNPs that induce structural change of RNA secondary structures
诱导RNA二级结构结构变化的SNP分析
批准号：
22700305
负责人：
SATO Kengo
金额：
$1.75万
依托单位：
Keio University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2010
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2010 至 2011
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22700305/
关键词：
RNA二次構造一塩基多型バイオインフォマティクス

项目摘要

项目成果

SATO Kengo的其他基金

相似基金

相关文献

中文摘要
翻译
我们开发了一种有效的算法来检测SNPs对RNA序列引起的RNA二级结构的结构变化。用我们的方法对SNP数据库进行综合分析，揭示了临床相关基因mRNAs编码区和非编码区的同义SNPs和非编码区SNP引起的结构变化的统计学意义。
英文摘要
We developed an efficient algorithm for detecting structural changes of RNA secondary structures induced by SNPs on RNA sequences. Comprehensive analysis on the SNP database using our method revealed statistical significance of structural changes induced by synonymous SNPs on coding regions and SNPs on non-coding regions of mRNAs from clinically associated genes.
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
機能性RNAのクラスタリング:大規模な配列から2次構造ファミリーを発見する
功能性RNA的聚类：从大序列中发现二级结构家族
DOI： --
发表时间： 2011
期刊：
影响因子： --
作者： [Okubo, T., 小松誠和, 篠田幸作, 斎藤裕]
通讯作者： 斎藤裕
Fast and accurate clustering of noncoding RNAs using ensembles of sequence alignments and secondary structures.
DOI： 10.1186/1471-2105-12-s1-s48
发表时间： 2011-02-15
期刊： BMC bioinformatics
影响因子： 3
作者： [Saito Y, Sato K, Sakakibara Y]
通讯作者： Sakakibara Y
RNA-seqによるメダカ機能性RNAのトランスクリプトーム解析
通过 RNA-seq 对青鳉功能性 RNA 进行转录组分析
DOI： --
发表时间： 2011
期刊：
影响因子： --
作者： [廣瀬修一, 花輪孟, 松山泰男, 野口保, Rui Yamaguchi, 阿部雅哉]
通讯作者： 阿部雅哉
BPLA kernels
BPLA 内核
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
共 19 条
    Investigation of novel vasoactive agents as biomarkers for ischemic heart disease.
    • 批准号：
      19K07900
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $2.83万
    • 财政年份：
      2019
    • 负责人：
      SATO Kengo
    • 依托单位：
      Hokkaido University
    Secretion of salusin-β from human monocyte-derived cells.
    海外基金