Assoziations-Analyse von SNP-Daten, die mit dem Expectation-Maximization-Algorithmus "In Silico" bestimmt wurden
Assoziations-Analyse von SNP-Daten, die mit dem Expectation-Maximization-Algorithmus "In Silico" bestimmt wurden
批准号:
81878785
负责人:
Privatdozent Dr. Tim Becker
金额:
$0.0万
依托单位国家:
德国
项目类别:
Research Grants
财政年份:
2009
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
2008-12-31 至 2012-12-31
中文摘要
软件包和数据包中的每一个项目都是这样的,它们是SNP-Daten auf Assoziation Testen kann,die zunächst“in Silico”mithilfe von HapMap-Daten oder Daten Aus and deren Quellen bstimt den.软件解决方案研究(GWASS)数据管理和数据管理。Der zugrunde Liegende Algulmus für die Bstimg der“in-Silico”-Genypen soll eine Erweterung des Expect-最大化-(EM-)算法在FAMHAP Implementiert中。对“In-Silico-Genypen”的参数进行了分析,并对其进行了优化研究。新的方法解决了现有的方法,分析了“In-Silico-Genypen”Verglichen。
英文摘要
Ziel des Projekts ist es, ein Softwarepaket zu entwickeln, das SNP-Daten auf Assoziation testen kann, die zunächst „In Silico“ mithilfe von HapMap-Daten oder Daten aus anderen Quellen bestimmt werden. Die Software soll speziell auf Genomweite Assoziationsstudien (GWAS) zugeschnitten sein und soll das dazu notwendige Datamanagement in einer öffentlich verfügbaren Plattform vereinfachen und unterstützten. Der zugrunde liegende Algorithmus für die Bestimmung der “In- Silico”-Genotypen soll eine Erweiterung des Expectation-Maximization-(EM- )Algorithmus sein, wie er in FAMHAP implementiert ist. Die Parameter die bei der Assoziationsanalyse der “In-Silico-Genotypen” auftreten sollen basierend auf den Ergebnissen einer großen Powersimulationsstudie optimiert werden. Die neue Methode soll mit existierenden Methoden für die Assoziationsanalyse von „In-Silico- Genotypen“ verglichen werden.
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会议论文
Identification of causal genes for nonsyndromic orofacial clefts using Whole Exome Sequencing
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批准号:267241232
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2015
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负责人:Privatdozent Dr. Tim Becker
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依托单位:
Meta-Analysis of Multiple Regression Models and Rare Variant Gene-Gene Interaction Analysis for Next Generation Sequencing Data
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批准号:54145271
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2007
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负责人:Privatdozent Dr. Tim Becker
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依托单位:
海外基金