Gene regulation in health and disease
Gene regulation in health and disease
批准号:
MC_UU_00029/3
负责人:
Jim Hughes
金额:
$491.46万
依托单位:
依托单位国家:
英国
项目类别:
Intramural
财政年份:
2022
资助国家:
英国
项目状态:
未结题
起止时间:
2022 至 --
中文摘要
像C.Elgans这样的简单生物体与人类的基因数量相似,尽管它只由几千个细胞组成,而人类则有数万亿个细胞。因此,这种复杂性的大幅增加与基因本身无关,而是与使用它们的组合的复杂性有关。因此,复杂的哺乳动物生命是建立在对基因使用(表达)的精确控制上的;它们何时何地被打开和关闭以及它们的表达水平。控制基因表达的“开关”位于基因组的“非编码”区域,而不是形成蛋白质生产蓝图的区域。然而,这代表了总基因组的约98%,并且激活这些开关的DNA代码在每种细胞类型中是不同的,因此理解控制基因表达的系统是非常复杂的。然而,了解这些机制对人类健康极其重要,因为与所有常见人类疾病(心脏病,癌症,痴呆症,多发性硬化症等)相关的近90%的遗传基因都位于该区域内,并改变这些开关的活性。我们使用实验,计算和机器学习方法的组合来理解基因调控的基本原理,以解码常见的人类疾病遗传学。我们使用这些方法来了解受这些遗传学影响的基因和细胞功能,以最终指导治疗开发。
英文摘要
A simple organism like C.Elgans has similar numbers of genes as a human even though it is made of only a few thousand cells compared to the many trillions in a human. This massive increase in complexity is therefore not linked to the genes themselves, but rather to the complexity of the combinations in which they are used. Therefore, complex mammalian life is founded on exquisite control of gene usage (expression); when and where they are switched on and off and their level of expression. The “switches” that control gene expression are located in the “non-coding” region of the genome rather than the regions that form the blueprint for production of the proteins of which we are made. However, this represents ~98% of the total genome and the DNA code that activates these switches is different in each cell type so understanding the systems that control gene expression is extremely complex. However, understanding these mechanisms is extremely important for human heath as nearly 90% of the genetics linked to all common human diseases (Heart disease, cancer, dementia, multiple sclerosis etc) lie within this region and change the activity of these switches. We use a combination of experimental, computational and machine learning approaches to understand the basic principles of gene regulation to decode common human disease genetics. We use these approaches to understand the genes and cellular functions affected by these genetics to ultimately guide therapeutic development.
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Chromatin interaction maps identify Wnt responsive cis-regulatory elements coordinating Paupar-Pax6 expression in neuronal cells.
染色质相互作用图识别Wnt响应的顺式调节元件,可在神经元细胞中协调PAUPAR-PAX6表达。
DOI:
10.1371/journal.pgen.1010230
发表时间:
2022-06
期刊:
PLoS genetics
影响因子:
4.5
作者:
[]
通讯作者:
DOI:
10.1016/j.tig.2021.10.008
发表时间:
2021-11
期刊:
Trends in genetics : TIG
影响因子:
--
作者:
[J. C. Herrmann;Robert A. Beagrie;J. Hughes]
通讯作者:
J. C. Herrmann;Robert A. Beagrie;J. Hughes
DOI:
10.1093/bioinformatics/btac525
发表时间:
2022-09-15
期刊:
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
DOI:
10.1101/2023.09.07.556660
发表时间:
2023-09
期刊:
bioRxiv
影响因子:
--
作者:
[Rosa J. Stolper;Felice H. Tsang;E. Georgiades;Lars L.P. Hansen;D. Downes;Caroline L. Harrold;J. Hughes;Robert A. Beagrie;Benjamin Davies;Mira T. Kassouf;D. Higgs]
通讯作者:
Rosa J. Stolper;Felice H. Tsang;E. Georgiades;Lars L.P. Hansen;D. Downes;Caroline L. Harrold;J. Hughes;Robert A. Beagrie;Benjamin Davies;Mira T. Kassouf;D. Higgs
Author Correction: Capture-C: a modular and flexible approach for high-resolution chromosome conformation capture.
作者更正:Capture-C:一种用于高分辨率染色体构象捕获的模块化且灵活的方法。
DOI:
10.1038/s41596-023-00860-5
发表时间:
2023
期刊:
Nature protocols
影响因子:
14.8
作者:
[Downes DJ]
通讯作者:
Downes DJ
共 6 条
Three-dimensional interrogation of gene regulation using next generation chromatin conformation capture and super-resolution imaging.
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批准号:MR/N00969X/1
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项目类别:Research Grant
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资助金额:$48.71万
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财政年份:2016
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负责人:Jim Hughes
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依托单位:
国内基金
海外基金
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Got2基因对浆细胞样树突状细胞功能的调控及其在系统性红斑狼疮疾病中的作用研究
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批准号:82371801
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项目类别:面上项目
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资助金额:47.00万元
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批准年份:2023
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负责人:周海波
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依托单位:
精氨酸调控骨髓Tregs稳态在脓毒症骨髓功能障碍中的作用研究
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批准号:82371770
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项目类别:面上项目
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资助金额:49.00万元
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批准年份:2023
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负责人:宁铂涛
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依托单位:
糖尿病ED中成纤维细胞衰老调控内皮细胞线粒体稳态失衡的机制研究
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批准号:82371634
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项目类别:面上项目
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资助金额:49.00万元
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批准年份:2023
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负责人:赵福军
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依托单位:
亚低温调控颅脑创伤急性期神经干细胞Mpc2/Lactate/H3K9lac通路促进神经修复的研究
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批准号:82371379
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项目类别:面上项目
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资助金额:49.00万元
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批准年份:2023
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负责人:冯军峰
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依托单位:
PRNP调控巨噬细胞M2极化并减弱吞噬功能促进子宫内膜异位症进展的机制研究
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批准号:82371651
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项目类别:面上项目
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资助金额:49.00万元
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批准年份:2023
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负责人:赵栋
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依托单位:
CBP/p300-HADH轴在基础胰岛素分泌调节中的作用和机制研究
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批准号:82370798
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项目类别:面上项目
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资助金额:49.00万元
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批准年份:2023
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负责人:王晓
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依托单位:
TIPE2调控巨噬细胞M2极化改善睑板腺功能障碍的作用机制研究
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批准号:82371028
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项目类别:面上项目
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资助金额:49.00万元
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批准年份:2023
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负责人:赵慧
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依托单位:
α-酮戊二酸调控ACMSD介导犬尿氨酸通路代谢重编程在年龄相关性听力损失中的作用及机制研究
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批准号:82371150
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项目类别:面上项目
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资助金额:49.00万元
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批准年份:2023
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负责人:侯书乐
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依托单位:
PfAP2-R介导的PfCRT转录调控在恶性疟原虫对喹啉类药物抗性中的作用及机制研究
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批准号:82372275
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项目类别:面上项目
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资助金额:49.00万元
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批准年份:2023
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负责人:刘耀宝
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依托单位:
mPFC-VTA-NAc多巴胺能投射调控丙泊酚麻醉—觉醒的机制研究
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批准号:82371284
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项目类别:面上项目
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资助金额:49.00万元
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批准年份:2023
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负责人:许涛
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依托单位: