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SOFTWARE DEVELOPMENT TO CONVERT TOPOLOGY FILES FROM AMBER TO GROMACS FORMAT

SOFTWARE DEVELOPMENT TO CONVERT TOPOLOGY FILES FROM AMBER TO GROMACS FORMAT
将拓扑文件从 AMBER 格式转换为 GROMACS 格式的软件开发
批准号：
8361807
负责人：
ROBERT J WOODS
金额：
$0.18万
依托单位：
UNIVERSITY OF GEORGIA
依托单位国家：
美国
项目类别：
财政年份：
2011
资助国家：
美国
项目状态：
已结题
起止时间：
2011-02-01 至 2012-01-31
来源：
https://reporter.nih.gov/project-details/8361807
关键词：
AmberFundingGrantNational Center for Research ResourcesPrincipal InvestigatorResearchResearch InfrastructureResourcesRunningSourceUnited States National Institutes of Healthcomputerized toolscostfile formatsimulationsoftware development

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
这个子项目是利用资源的许多研究子项目之一。 由NIH/NCRR资助的中心拨款提供。对子项目的主要支持 子项目的首席调查员可能是由其他来源提供的， 包括美国国立卫生研究院的其他来源。为子项目列出的总成本可能 表示该子项目使用的中心基础设施的估计数量， 不是由NCRR赠款提供给次级项目或次级项目工作人员的直接资金。 为了帮助GLYCAM力场的传播，正在开发一种计算工具，该工具将自动转换文件格式，以便可以使用琥珀或GROMACS模拟包来运行具有GLYCAM力场的MD模拟。
英文摘要
This subproject is one of many research subprojects utilizing the resources provided by a Center grant funded by NIH/NCRR. Primary support for the subproject and the subproject's principal investigator may have been provided by other sources, including other NIH sources. The Total Cost listed for the subproject likely represents the estimated amount of Center infrastructure utilized by the subproject, not direct funding provided by the NCRR grant to the subproject or subproject staff. To aid in the dissemination of the GLYCAM force field, a computational tool is being developed that will automatically convert file formats so that either the AMBER or GROMACS simulational packages may be employed to run MD simulations with the GLYCAM force field.
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会议论文
Computational tools to aid the design of glycomimetic agents
  • 批准号：
    10477037
  • 项目类别：
  • 资助金额：
    $37.43万
  • 财政年份：
    2020
  • 负责人：
    ROBERT J WOODS
  • 依托单位：
    UNIVERSITY OF GEORGIA
Transitioning GLYCAM-Web to a self-sustaining carbohydrate modeling service
  • 批准号：
    10391344
  • 项目类别：
  • 资助金额：
    $41.53万
  • 财政年份：
    2020
  • 负责人：
    ROBERT J WOODS
  • 依托单位：
    UNIVERSITY OF GEORGIA
Computational tools to aid the design of glycomimetic agents
  • 批准号：
    10245292
  • 项目类别：
  • 资助金额：
    $37.43万
  • 财政年份：
    2020
  • 负责人：
    ROBERT J WOODS
  • 依托单位：
    UNIVERSITY OF GEORGIA
INTEGRATION OF GLYCAM SIMULATIONAL METHODS WITHIN THE CFG
  • 批准号：
    8361795
  • 项目类别：
  • 资助金额：
    $0.18万
  • 财政年份：
    2011
  • 负责人：
    ROBERT J WOODS
  • 依托单位：
    UNIVERSITY OF GEORGIA
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