课题基金 / 基金详情

Statistics and Algorithms in Evolution

Statistics and Algorithms in Evolution
进化中的统计和算法
批准号：
8943248
负责人：
John Spouge
金额：
$23.92万
依托单位：
NATIONAL LIBRARY OF MEDICINE
依托单位国家：
美国
项目类别：
财政年份：
--
资助国家：
美国
项目状态：
未结题
起止时间：
至
来源：
https://reporter.nih.gov/project-details/8943248
关键词：
AlgorithmsCombinatoricsComputational algorithmDNAEvolutionJavaMonte Carlo MethodProbabilityProcessReportingSample SizeSamplingStatistical AlgorithmTimecombinatorialcomputer frameworkcomputer programcomputing resourcescostimprovedtheoriesuser-friendly

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中文摘要
翻译
Tewari博士用Java开发了一个可扩展的面向对象框架的计算资源，用于处理精确的合并递归和进行重要性抽样的蒙特卡罗模拟。 我们提高了对合并结果的组合理解，导致了对合并算法的具体改进。特别是，对于合并概率的重要抽样，Tewari博士和Spouge博士在框架内应用了精确的概率计算，将有效样本量增加了约4，而计算时间的成本可以忽略不计。 Spouge博士还在他的DNA条形码项目(LM200883)中报告了与条形码采样策略相关的一些合并结果。
英文摘要
Dr Tewari has developed computational resources with an expansible object-oriented framework in Java for handling exact coalescent recursions and doing Monte Carlo simulations with importance sampling. We have advanced our combinatorial understanding of coalescent results, resulting in concrete improvements to coalescent algorithms. In particular, for importance sampling of coalescent probabilities, Drs. Tewari and Spouge have applied exact probability calculations within the framework to increase the effective sample size by about four with negligible costs in computation time. Dr. Spouge has also developed some coalescent results relevant to barcode sampling strategies, reported in his project on DNA barcodes (LM200883).
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会议论文
Bioinformatics Studies of Human Viruses
  • 批准号：
    10471119
  • 项目类别：
  • 资助金额：
    $16.98万
  • 财政年份：
    --
  • 负责人：
    John Spouge
  • 依托单位：
    NATIONAL LIBRARY OF MEDICINE
Taxonomics Methods Using DNA
  • 批准号：
    10471121
  • 项目类别：
  • 资助金额：
    $7.49万
  • 财政年份：
    --
  • 负责人：
    John Spouge
  • 依托单位：
    NATIONAL LIBRARY OF MEDICINE
Quantitation Of Viral Reproduction
  • 批准号：
    7969216
  • 项目类别：
  • 资助金额：
    $2.76万
  • 财政年份：
    --
  • 负责人：
    John Spouge
  • 依托单位：
    NATIONAL LIBRARY OF MEDICINE
Global Alignment of Protein Sequences with Position-Specific Scoring Matrices.
  • 批准号：
    8558118
  • 项目类别：
  • 资助金额：
    $6.51万
  • 财政年份：
    --
  • 负责人：
    John Spouge
  • 依托单位：
    NATIONAL LIBRARY OF MEDICINE
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