Tools For High-Throughput High-Resolution Three Dimensional Electron Microscopy
Tools For High-Throughput High-Resolution Three Dimensional Electron Microscopy
批准号:
9318780
负责人:
SCOTT M STAGG
金额:
$31.94万
依托单位:
依托单位国家:
美国
项目类别:
财政年份:
2015
资助国家:
美国
项目状态:
已结题
起止时间:
2015-09-30 至 2021-06-30
关键词:
BiologicalComplexComputer softwareDataData CollectionDetectionDevicesDimensionsDiseaseDoseElectron MicroscopyElectronsFinancial compensationGenerationsHealthHumanImageMicrofluidicsMolecularMotionNegative StainingPerformancePreparationProteinsReproducibilityResearchResearch InfrastructureResearch PersonnelResolutionSamplingSeriesSideSoftware ToolsSpecimenStructureSystemTechniquesTimebeta-Galactosidasecomputerized data processingcryogenicsdensitydetectorelectron tomographyfallshuman diseaseimaging modalityimprovedinnovationmolecular assembly/self assemblyparticleprotein complexprotein structurereconstructionscreeningtomographytool
中文摘要
总结
三维电子显微镜(3DEM)是一套用于确定结构的技术,
大蛋白质和蛋白质复合物。已经表明,低温EM(cryo-EM)具有以下能力:
以足够高的分辨率确定结构,以明确地将侧链放置在EM密度中。
虽然低温EM越来越接近原子分辨率,但在这方面存在许多障碍。
为了实现侧链水平的分辨率,结构测定低对称性和无对称性
配合物在这里,我们建议开发工具,以促进高通量高分辨率3DEM。在
第一个目标,我们建议开发工具,使自动化标本制备和筛选,
为直接电子探测提供了新的工具。在第二个目标中,我们建议开发工具,
断层摄影数据收集和处理,包括探索新的图像采集模式
以及用于开发用于处理断层摄影子体积的基础设施。这项研究将有利于
通过促进确定与人类疾病相关的蛋白质结构来促进人类健康。
英文摘要
Summary
Three-dimensional electron microscopy (3DEM) is a set of techniques for determining the structures of
large proteins and protein complexes. It has been shown that cryogenic EM (cryo-EM) has the ability to
determine structures to high enough resolution to unambiguously place side chains in the EM density.
Though cryo-EM is increasingly reaching near-atomic resolution, a number of hurdles are present in
order to achieve side-chain level resolution structure determination of low-symmetry and no symmetry
complexes. Here we propose to develop tool to facilitate high-throughput high-resolution 3DEM. In the
first aim, we propose to develop tools to enable automated specimen preparation and screening, and
enable a new tools for direct electron detection. In the second aim, we propose to develop tools for
tomographic data collection and processing including exploring new modalities for image acquisition
and for developing an infrastructure for processing tomographic subvolumes. This research will benefit
human health by facilitating the determination of protein structures that are relevant for human disease.
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Acquisition of a Glacios Cryo-TEM for the Biological Sciences Imaging Resource
-
批准号:10632855
-
项目类别:
-
资助金额:$200.0万
-
财政年份:2023
-
负责人:SCOTT M STAGG
-
依托单位:
Tools for Enabling Challenging Structure Determination by Cryo-EM
-
批准号:10744600
-
项目类别:
-
资助金额:$44.93万
-
财政年份:2023
-
负责人:SCOTT M STAGG
-
依托单位:
The Southeastern Center for Microscopy of Macromolecular Machines (SECM4)
-
批准号:10431456
-
项目类别:
-
资助金额:$116.44万
-
财政年份:2022
-
负责人:SCOTT M STAGG
-
依托单位:
The Southeastern Center for Microscopy of Macromolecular Machines (SECM4)
-
批准号:10675030
-
项目类别:
-
资助金额:$120.38万
-
财政年份:2022
-
负责人:SCOTT M STAGG
-
依托单位:
Tools for High-Throughput High-Resolution Three Dimensional Electron Microscopy
-
批准号:8817532
-
项目类别:
-
资助金额:$28.78万
-
财政年份:2015
-
负责人:SCOTT M STAGG
-
依托单位:
The Structure and Assembly of the COPII Coat
-
批准号:8520327
-
项目类别:
-
资助金额:$25.0万
-
财政年份:2010
-
负责人:SCOTT M STAGG
-
依托单位:
The Structure and Assembly of the COPII Coat
-
批准号:8310036
-
项目类别:
-
资助金额:$25.98万
-
财政年份:2010
-
负责人:SCOTT M STAGG
-
依托单位:
The Structure and Assembly of the COPII Coat
-
批准号:8705537
-
项目类别:
-
资助金额:$25.84万
-
财政年份:2010
-
负责人:SCOTT M STAGG
-
依托单位:
The Structure and Assembly of the COPII Coat
-
批准号:8115830
-
项目类别:
-
资助金额:$26.04万
-
财政年份:2010
-
负责人:SCOTT M STAGG
-
依托单位:
The Structure and Assembly of the COPII Coat
-
批准号:7987056
-
项目类别:
-
资助金额:$24.17万
-
财政年份:2010
-
负责人:SCOTT M STAGG
-
依托单位:
250K PARTICLE PROJECT
-
批准号:7602718
-
项目类别:
-
资助金额:$5.37万
-
财政年份:2007
-
负责人:SCOTT M STAGG
-
依托单位:
250K PARTICLE PROJECT
-
批准号:7369594
-
项目类别:
-
资助金额:$5.04万
-
财政年份:2006
-
负责人:SCOTT M STAGG
-
依托单位:
Using Cryo-EM to Study the Structure of COPII Coats
-
批准号:6884541
-
项目类别:
-
资助金额:$4.83万
-
财政年份:2005
-
负责人:SCOTT M STAGG
-
依托单位:
STRUCTURE OF COPII COATED VESICLES
-
批准号:7183082
-
项目类别:
-
资助金额:$1.31万
-
财政年份:2005
-
负责人:SCOTT M STAGG
-
依托单位:
Using Cryo-EM to Study the Structure of COPII Coats
-
批准号:7010741
-
项目类别:
-
资助金额:$5.04万
-
财政年份:2005
-
负责人:SCOTT M STAGG
-
依托单位:
CRYO-EM TO STUDY THE STRUCTURE OF COPII COATED VESICLES
-
批准号:6979098
-
项目类别:
-
资助金额:$1.28万
-
财政年份:2004
-
负责人:SCOTT M STAGG
-
依托单位:
国内基金
海外基金
登录
查看更多内容
TPLATE Complex通过胞吞调控CLV3-CLAVATA多肽信号模块维持干细胞稳态的分子机制研究
-
批准号:32370337
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:50万元
-
批准年份:2023
-
负责人:王杰
-
依托单位:
二甲双胍对于模型蛋白、γ-secretase、Complex I自由能曲面的影响
-
批准号:--
-
项目类别:青年科学基金项目
-
资助金额:30万元
-
批准年份:2022
-
负责人:郭子龙
-
依托单位:
高脂饮食损伤巨噬细胞ndufs4表达激活Complex I/mROS/HIF-1通路参与溃疡性结肠炎研究
-
批准号:--
-
项目类别:青年科学基金项目
-
资助金额:30万元
-
批准年份:2022
-
负责人:赵锐
-
依托单位:
线粒体参与呼吸中枢pre-Bötzinger complex呼吸可塑性调控的机制研究
-
批准号:31971055
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:58.0万元
-
批准年份:2019
-
负责人:刘莹莹
-
依托单位:
北温带中华蹄盖蕨复合体Athyrium sinense complex的物种分化
-
批准号:31872651
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:60.0万元
-
批准年份:2018
-
负责人:张宪春
-
依托单位:
边缘鳞盖蕨复合体种 (Microlepia marginata complex) 的网状进化及物种形成研究
-
批准号:31860044
-
项目类别:地区科学基金项目
-
资助金额:37.0万元
-
批准年份:2018
-
负责人:王任翔
-
依托单位:
益气通络颗粒及主要单体通过调节cAMP/PKA/Complex I通路治疗气虚血瘀证脑梗死的机制研究
-
批准号:81703747
-
项目类别:青年科学基金项目
-
资助金额:20.0万元
-
批准年份:2017
-
负责人:薛冰洁
-
依托单位:
生物钟转录抑制复合体 Evening Complex 调控茉莉酸诱导叶片衰老的分子机制研究
-
批准号:31670290
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:62.0万元
-
批准年份:2016
-
负责人:张媛媛
-
依托单位:
延伸子复合物(Elongator complex)的翻译调控作用
-
批准号:31360023
-
项目类别:地区科学基金项目
-
资助金额:51.0万元
-
批准年份:2013
-
负责人:黄波
-
依托单位:
Complex I 基因变异与寿命的关联及其作用机制的研究
-
批准号:81370445
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:70.0万元
-
批准年份:2013
-
负责人:杨泽
-
依托单位: