Combined effects of host genetics and diet on human gut microbiota and incident disease in a single population cohort.
Combined effects of host genetics and diet on human gut microbiota and incident disease in a single population cohort.
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DOI：
10.1038/s41588-021-00991-z
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发表时间：
2022-02
期刊：
影响因子：
30.8
通讯作者：
Meric, Guillaume
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Qin, Youwen;Havulinna, Aki S.;Liu, Yang;Jousilahti, Pekka;Ritchie, Scott C.;Tokolyi, Alex;Sanders, Jon G.;Valsta, Liisa;Brozynska, Marta;Zhu, Qiyun;Tripathi, Anupriya;Vazquez-Baeza, Yoshiki;Loomba, Rohit;Cheng, Susan;Jain, Mohit;Niiranen, Teemu;Lahti, Leo;Knight, Rob;Salomaa, Veikko;Inouye, Michael;Meric, Guillaume
人类遗传变异通过环境和宿主因素的复杂组合影响肠道微生物群。在这里，我们描述了与微生物丰度相关的遗传变异，这些遗传变异是在一个单一的大规模人群队列中进行的，该队列由5，959名基因型个体组成，这些个体具有匹配的肠道微生物宏基因组，以及饮食和健康记录（流行和随访）。我们确定了567个独立的SNP分类群关联。LCT位点的变异与双歧杆菌和其他类群相关，但它们因乳制品摄入量而异。此外，乳酸粪肠球菌的水平与ABO相关，并建议优先利用分泌的血液抗原作为肠道中的能量来源。粪肠球菌水平与MED 13 L基因座变异相关，该基因座与结直肠癌有关。孟德尔随机化分析表明摩根氏菌对重度抑郁症的潜在因果关系，与观察性事件疾病分析一致。总的来说，我们确定并表征了宿主-微生物群相互作用的复杂性质及其与疾病的关联。
Human genetic variation affects the gut microbiota through a complex combination of environmental and host factors. Here we characterize genetic variations associated with microbial abundances in a single large-scale population-based cohort of 5,959 genotyped individuals with matched gut microbial metagenomes, and dietary and health records (prevalent and follow-up). We identified 567 independent SNP–taxon associations. Variants at the LCT locus associated with Bifidobacterium and other taxa, but they differed according to dairy intake. Furthermore, levels of Faecalicatena lactaris associated with ABO, and suggested preferential utilization of secreted blood antigens as energy source in the gut. Enterococcus faecalis levels associated with variants in the MED13L locus, which has been linked to colorectal cancer. Mendelian randomization analysis indicated a potential causal effect of Morganella on major depressive disorder, consistent with observational incident disease analysis. Overall, we identify and characterize the intricate nature of host–microbiota interactions and their association with disease.
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DOI：
10.1007/s10482-018-1040-x
发表时间：
2018-06
期刊：
Antonie van Leeuwenhoek
影响因子：
--
作者：
Chia LW;Hornung BVH;Aalvink S;Schaap PJ;de Vos WM;Knol J;Belzer C
通讯作者：
Belzer C
影响因子：
9.2
作者：
Chang CC;Chow CC;Tellier LC;Vattikuti S;Purcell SM;Lee JJ
通讯作者：
Lee JJ
影响因子：
7.7
作者：
Borodulin, Katja;Tolonen, Hanna;Vartiainen, Erkki
通讯作者：
Vartiainen, Erkki
DOI：
10.1002/wsbm.1355
发表时间：
2016-11
影响因子：
7.9
作者：
Ewald, D. Rose;Sumner, Susan C. J.
通讯作者：
Sumner, Susan C. J.
影响因子：
5.4
作者：
Arnolds, Kathleen L.;Martin, Casey G.;Lozupone, Catherine A.
通讯作者：
Lozupone, Catherine A.