Mutational and topological analysis of the Escherichia coli BamA protein.
Mutational and topological analysis of the Escherichia coli BamA protein.
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DOI：
10.1371/journal.pone.0084512
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发表时间：
2013
期刊：
影响因子：
3.7
通讯作者：
Henderson IR
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Browning DF;Matthews SA;Rossiter AE;Sevastsyanovich YR;Jeeves M;Mason JL;Wells TJ;Wardius CA;Knowles TJ;Cunningham AF;Bavro VN;Overduin M;Henderson IR
大肠杆菌多蛋白β-Barrel装配机负责将含有完整外膜蛋白的β-Barrel折叠并插入细菌外膜。该复合体的一个重要组成部分是BAMA蛋白，它通过其N-末端的5个多肽运输相关(β)结构域与未折叠的POTRA-Barrel前体结合。BAMA的C末端含有一个β桶结构域，它将BAMA连接到外膜上，也被认为参与了omp的插入。在这里，我们使用接头扫描突变来诱变BAMA，并在我们的实验系统中证明了所有五个POTRA结构域都是BAMA蛋白功能所必需的。此外，我们建立了一个基于同源性的BAMAβ桶模型，并使用插入突变、缺失分析和免疫荧光来验证我们的模型，以识别β链、周质转弯和细胞外环。我们证明了BAMAβ-Barrel的表面暴露回路是必不可少的。
The multi-protein β-barrel assembly machine (BAM) of Escherichia coli is responsible for the folding and insertion of β-barrel containing integral outer membrane proteins (OMPs) into the bacterial outer membrane. An essential component of this complex is the BamA protein, which binds unfolded β-barrel precursors via the five polypeptide transport-associated (POTRA) domains in its N-terminus. The C-terminus of BamA contains a β-barrel domain, which tethers BamA to the outer membrane and is also thought to be involved in OMP insertion. Here we mutagenize BamA using linker scanning mutagenesis and demonstrate that all five POTRA domains are essential for BamA protein function in our experimental system. Furthermore, we generate a homology based model of the BamA β-barrel and test our model using insertion mutagenesis, deletion analysis and immunofluorescence to identify β-strands, periplasmic turns and extracellular loops. We show that the surface-exposed loops of the BamA β-barrel are essential.
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DOI：
10.1016/j.str.2010.08.012
发表时间：
2010-11-10
期刊：
Structure (London, England : 1993)
影响因子：
--
作者：
Gatzeva-Topalova PZ;Warner LR;Pardi A;Sousa MC
通讯作者：
Sousa MC
影响因子：
3.1
作者：
Raghunathan, Dhaarini;Wells, Timothy J.;Henderson, Ian R.
通讯作者：
Henderson, Ian R.
影响因子：
56.9
作者：
Kim, Seokhee;Malinverni, Juliana C.;Kahne, Daniel
通讯作者：
Kahne, Daniel
影响因子：
3.6
作者：
Aoki, Stephanie K.;Malinverni, Juliana C.;Jacoby, Kyle;Thomas, Benjamin;Pamma, Rupinderjit;Trinh, Brooke N.;Remers, Susan;Webb, Julia;Braaten, Bruce A.;Silhavy, Thomas J.;Low, David A.
通讯作者：
Low, David A.
影响因子：
3.6
作者：
Bennion D;Charlson ES;Coon E;Misra R
通讯作者：
Misra R