Intrinsic coupling of lagging-strand synthesis to chromatin assembly.
Intrinsic coupling of lagging-strand synthesis to chromatin assembly.
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DOI：
10.1038/nature10895
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发表时间：
2012-03-14
期刊：
影响因子：
64.8
通讯作者：
Whitehouse, Iestyn
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Smith, Duncan J.;Whitehouse, Iestyn
百分之五十的基因组作为冈崎片段在滞后链上不连续地复制。真核冈崎片段的表征仍然很差，而且由于核小体快速沉积在新生 DNA 上，冈崎片段加工和核小体组装可能会相互影响。在这里，我们展示了酿酒酵母中具有连接能力的冈崎片段的大小是根据核小体重复序列确定的。使用深度测序，我们证明连接点优先发生在核小体中点附近，而不是在核小体间接头区域。破坏染色质组装或滞后链聚合酶的持续合成能力会影响冈崎片段的大小和分布，这表明在复制叉通过后立即组装的新生染色质在终止冈崎片段合成中发挥着作用。据我们所知，我们的研究代表了对体内真核冈崎片段的首次高分辨率分析，并揭示了滞后链合成和染色质组装之间的相互联系。
Fifty per cent of the genome is discontinuously replicated on the lagging strand as Okazaki fragments. Eukaryotic Okazaki fragments remain poorly characterized and, because nucleosomes are rapidly deposited on nascent DNA, Okazaki fragment processing and nucleosome assembly potentially affect one another. Here we show that ligation-competent Okazaki fragments in Saccharomyces cerevisiae are sized according to the nucleosome repeat. Using deep sequencing, we demonstrate that ligation junctions preferentially occur near nucleosome midpoints rather than in internucleosomal linker regions. Disrupting chromatin assembly or lagging-strand polymerase processivity affects both the size and the distribution of Okazaki fragments, suggesting a role for nascent chromatin, assembled immediately after the passage of the replication fork, in the termination of Okazaki fragment synthesis. Our studies represent the first high-resolution analysis—to our knowledge— of eukaryotic Okazaki fragments in vivo, and reveal the interconnection between lagging-strand synthesis and chromatin assembly.
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影响因子：
16
作者：
Badis, Gwenael;Chan, Esther T.;van Bakel, Harm;Pena-Castillo, Lourdes;Tillo, Desiree;Tsui, Kyle;Carlson, Clayton D.;Gossett, Andrea J.;Hasinoff, Michael J.;Warren, Christopher L.;Gebbia, Marinella;Talukder, Shaheynoor;Yang, Ally;Mnaimneh, Sanie;Terterov, Dimitri;Coburn, David;Yeo, Ai Li;Yeo, Zhen Xuan;Clarke, Neil D.;Lieb, Jason D.;Ansari, Aseem Z.;Nislow, Corey;Hughes, Timothy R.
通讯作者：
Hughes, Timothy R.
影响因子：
64.8
作者：
JOHNSTON, LH;NASMYTH, KA
通讯作者：
NASMYTH, KA
影响因子：
10.5
作者：
Eaton, Matthew L.;Galani, Kyriaki;MacAlpine, David M.
通讯作者：
MacAlpine, David M.
DOI：
10.1073/pnas.1635158100
发表时间：
2003-10-14
影响因子：
11.1
作者：
Hoek, M;Stillman, B
通讯作者：
Stillman, B
影响因子：
64.5
作者：
Hartley PD;Madhani HD
通讯作者：
Madhani HD