DrosoPhyla: Resources for Drosophilid Phylogeny and Systematics.
DrosoPhyla: Resources for Drosophilid Phylogeny and Systematics.
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DOI：
10.1093/gbe/evab179
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发表时间：
2021-08-03
影响因子：
3.3
通讯作者：
Marlétaz F
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Finet C;Kassner VA;Carvalho AB;Chung H;Day JP;Day S;Delaney EK;De Ré FC;Dufour HD;Dupim E;Izumitani HF;Gautério TB;Justen J;Katoh T;Kopp A;Koshikawa S;Longdon B;Loreto EL;Nunes MDS;Raja KKB;Rebeiz M;Ritchie MG;Saakyan G;Sneddon T;Teramoto M;Tyukmaeva V;Vanderlinde T;Wey EE;Werner T;Williams TM;Robe LJ;Toda MJ;Marlétaz F
醋蝇果蝇是无脊椎动物发育、遗传学、生理学、神经科学和疾病的关键模型。整个果蝇科包含 4,400 多个物种，为比较和进化研究提供了大量案例。尽管系统发育推断有着悠久的历史，但果蝇科属、亚属和种群之间的许多关系仍未解决。为了阐明这些关系，我们首先开发了一组新的基因组标记，并组装了来自 704 个果蝇科物种的 17 个基因的多位点数据集。然后我们推断出一个物种树，其中包含该科得到高度支持的群体。此外，我们还能够确定一些以前未定位的物种的系统发育位置。这些结果为研究果蝇性状的进化建立了一个新的框架，并为系统学提供了宝贵的资源。
The vinegar fly Drosophila melanogaster is a pivotal model for invertebrate development, genetics, physiology, neuroscience, and disease. The whole family Drosophilidae, which contains over 4,400 species, offers a plethora of cases for comparative and evolutionary studies. Despite a long history of phylogenetic inference, many relationships remain unresolved among the genera, subgenera, and species groups in the Drosophilidae. To clarify these relationships, we first developed a set of new genomic markers and assembled a multilocus data set of 17 genes from 704 species of Drosophilidae. We then inferred a species tree with highly supported groups for this family. Additionally, we were able to determine the phylogenetic position of some previously unplaced species. These results establish a new framework for investigating the evolution of traits in fruit flies, as well as valuable resources for systematics.
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影响因子：
64.8
作者：
Clark, Andrew G.;Eisen, Michael B.;MacCallum, Iain
通讯作者：
MacCallum, Iain
影响因子：
3.6
作者：
Charbonnier, Sylvain;Audo, Denis;Simpson, Martin
通讯作者：
Simpson, Martin
影响因子：
3.3
作者：
Almeida FC;Sánchez-Gracia A;Campos JL;Rozas J
通讯作者：
Rozas J
影响因子：
3.7
作者：
Edwards, Kevin A.;Doescher, Linden T.;Yamamoto, Daisuke
通讯作者：
Yamamoto, Daisuke
DOI：
10.1073/pnas.2002092117
发表时间：
2020-05-26
影响因子：
11.1
作者：
Dufour, Heloise D.;Koshikawa, Shigeyuki;Finet, Cedric
通讯作者：
Finet, Cedric