No more non-model species: the promise of next generation sequencing for comparative immunology.
No more non-model species: the promise of next generation sequencing for comparative immunology.
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DOI：
10.1016/j.dci.2014.01.022
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发表时间：
2014-07
影响因子：
2.9
通讯作者：
Du Pasquier, Louis
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Dheilly, Nolwenn M.;Adema, Coen;Raftos, David A.;Gourbal, Benjamin;Grunau, Christoph;Du Pasquier, Louis
关键词：
下一代测序（NGS）允许对整个基因组和转录组进行快速、全面和成本有效的分析。NGS为免疫应答基因发现、寄生虫病过程中基因表达谱分析、研究免疫受体多样化机制以及调查表观遗传机制在调节免疫基因表达和/或多样化中的作用提供了方法。NGS将允许有意义的比较，以了解不同的环境病原体的压力下，不同的宿主防御策略的选择，从不同的类群的生物之间。同时，它将揭示免疫工具包的共享和独特组件以及对整个生物世界的免疫防御至关重要的基本功能方面。在这篇综述中，我们认为，NGS将彻底改变我们对整个动物王国的免疫反应的理解，因为它提供的信息的深度将绕过需要集中在几个“模型”物种。
Next generation sequencing (NGS) allows for the rapid, comprehensive and cost effective analysis of entire genomes and transcriptomes. NGS provides approaches for immune response gene discovery, profiling gene expression over the course of parasitosis, studying mechanisms of diversification of immune receptors and investigating the role of epigenetic mechanisms in regulating immune gene expression and/or diversification. NGS will allow meaningful comparisons to be made between organisms from different taxa in an effort to understand the selection of diverse strategies for host defence under different environmental pathogen pressures. At the same time, it will reveal the shared and unique components of the immunological toolkit and basic functional aspects that are essential for immune defence throughout the living world. In this review, we argue that NGS will revolutionize our understanding of immune responses throughout the animal kingdom because the depth of information it provides will circumvent the need to concentrate on a few “model” species.
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影响因子：
12.3
作者：
Cirulli ET;Singh A;Shianna KV;Ge D;Smith JP;Maia JM;Heinzen EL;Goedert JJ;Goldstein DB;Center for HIV/AIDS Vaccine Immunology (CHAVI)
通讯作者：
Center for HIV/AIDS Vaccine Immunology (CHAVI)
DOI：
10.1126/science.1240925
发表时间：
2013-08-16
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Carpenter S;Aiello D;Atianand MK;Ricci EP;Gandhi P;Hall LL;Byron M;Monks B;Henry-Bezy M;Lawrence JB;O'Neill LA;Moore MJ;Caffrey DR;Fitzgerald KA
通讯作者：
Fitzgerald KA
影响因子：
30.5
作者：
Ausubel, FM
通讯作者：
Ausubel, FM
影响因子：
4.4
作者：
Dheilly, Nowenn M.;Nair, Sham V.;Raftos, David A.
通讯作者：
Raftos, David A.
果蝇抗病毒抗性突变的年龄和演变。
DOI：
10.1098/rspb.2007.0611
发表时间：
2007-08-22
影响因子：
4.7
作者：
Bangham, Jenny;Obbard, Darren J.;Kim, Kang-Wook;Haddrill, Penelope R.;Jiggins, Francis M.
通讯作者：
Jiggins, Francis M.