Insights Into the Peroxisomal Protein Inventory of Zebrafish.
Insights Into the Peroxisomal Protein Inventory of Zebrafish.
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DOI：
10.3389/fphys.2022.822509
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发表时间：
2022
影响因子：
4
通讯作者：
Schrader M
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Kamoshita M;Kumar R;Anteghini M;Kunze M;Islinger M;Martins Dos Santos V;Schrader M
过氧化物酶体是普遍存在的氧化亚细胞细胞器，在细胞脂质代谢和氧化还原稳态中具有重要功能。过氧化物酶体功能的丧失会导致严重的发育和神经异常。斑马鱼正在成为研究过氧化物酶体疾病和细胞脂质代谢的有吸引力的脊椎动物模型。在这里，我们将生物信息学分析与分子细胞生物学相结合，揭示了丹尼奥河鼠过氧化物酶体蛋白的第一个全面清单，我们系统地将其与人类过氧化物酶体进行了比较。通过对所有携带pts1蛋白的生物信息学分析，我们证实了D. rerio缺乏两种众所周知的哺乳动物过氧化物酶体蛋白（BAAT和ZADH2/PTGR3），但具有假定的过氧化物酶体苹果酸合成酶（Mlsl），并且在嘌呤降解酶的存在上证实了差异。此外，我们还发现了新的候选过氧化物酶体蛋白，并讨论了其功能和定位。我们的研究结果证实了斑马鱼作为过氧化物酶体研究的脊椎动物模型的适用性，并为斑马鱼和人类研究新的过氧化物酶体候选蛋白开辟了可能性。
Peroxisomes are ubiquitous, oxidative subcellular organelles with important functions in cellular lipid metabolism and redox homeostasis. Loss of peroxisomal functions causes severe disorders with developmental and neurological abnormalities. Zebrafish are emerging as an attractive vertebrate model to study peroxisomal disorders as well as cellular lipid metabolism. Here, we combined bioinformatics analyses with molecular cell biology and reveal the first comprehensive inventory of Danio rerio peroxisomal proteins, which we systematically compared with those of human peroxisomes. Through bioinformatics analysis of all PTS1-carrying proteins, we demonstrate that D. rerio lacks two well-known mammalian peroxisomal proteins (BAAT and ZADH2/PTGR3), but possesses a putative peroxisomal malate synthase (Mlsl) and verified differences in the presence of purine degrading enzymes. Furthermore, we revealed novel candidate peroxisomal proteins in D. rerio, whose function and localisation is discussed. Our findings confirm the suitability of zebrafish as a vertebrate model for peroxisome research and open possibilities for the study of novel peroxisomal candidate proteins in zebrafish and humans.
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DOI：
10.1007/s00018-020-03687-5
发表时间：
2021-03
期刊：
Cellular and molecular life sciences : CMLS
影响因子：
--
作者：
Covill-Cooke C;Toncheva VS;Kittler JT
通讯作者：
Kittler JT
影响因子：
--
作者：
Costello, Joseph L;Passmore, Josiah B;Schrader, Michael
通讯作者：
Schrader, Michael
影响因子：
64.5
作者：
Dixit E;Boulant S;Zhang Y;Lee AS;Odendall C;Shum B;Hacohen N;Chen ZJ;Whelan SP;Fransen M;Nibert ML;Superti-Furga G;Kagan JC
通讯作者：
Kagan JC
影响因子：
6
作者：
Beasley HK;Rodman TA;Collins GV;Hinton A Jr;Exil V
通讯作者：
Exil V
影响因子：
2.9
作者：
Den Broeder MJ;Kopylova VA;Kamminga LM;Legler J
通讯作者：
Legler J