A newly identified bocavirus species in human stool.
A newly identified bocavirus species in human stool.
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DOI：
10.1086/595831
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发表时间：
2009-01-15
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Delwart E
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Kapoor A;Slikas E;Simmonds P;Chieochansin T;Naeem A;Shaukat S;Alam MM;Sharif S;Angez M;Zaidi S;Delwart E
利用病毒宏基因组学，我们在人类粪便中发现了一种新型细小病毒，其系统发育关系最近的是人类博卡病毒（HBoV）。 HBoV2 具有与 HBoV 相同的基因组结构，但与其 NS1、NP1 和 VP1/VP2 蛋白仅具有 78%、67% 和 80% 的同一性。我们使用 PCR 在 5/98 份巴基斯坦儿童粪便样本和 3/699 份英国粪便样本中检测到了 HBoV2 序列。近全基因组测序显示存在三种不同的基因型和重组的证据。需要进一步的研究来确定 HBoV2 的复制位点以及与临床症状或疾病的潜在关联。
Using viral metagenomics we identified a novel parvovirus species in human stool whose closest phylogenetic relative is the human bocavirus (HBoV). HBoV2 has an identical genomic organization to HBoV but share only 78%, 67%, and 80% identity to its NS1, NP1 and VP1/VP2 proteins. Using PCR we detected HBoV2 sequences in 5/98 Pakistani children stool samples and 3/699 stool samples from the UK. Near full genome sequencing showed the presence of three divergent genotypes and evidence of recombination. Further studies are required to determine sites of replication of HBoV2 and potential associations with clinical symptoms or disease.
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DOI：
10.1073/pnas.0504666102
发表时间：
2005-09-06
影响因子：
11.1
作者：
Allander, T;Tammi, MT;Andersson, B
通讯作者：
Andersson, B
影响因子：
5.4
作者：
Kapoor, A.;Victoria, J.;Delwart, E.
通讯作者：
Delwart, E.
影响因子：
6.4
作者：
Lee, Jae In;Chung, Ju-Young;Hwang, Eung-Soo
通讯作者：
Hwang, Eung-Soo
影响因子：
11.8
作者：
Kantola, Kalle;Hedman, Lea;Soderlund-Venermo, Maria
通讯作者：
Soderlund-Venermo, Maria
影响因子：
11.8
作者：
Albuquerque, Maria Carolina M.;Rocha, Ludmila N.;Santos, Norma
通讯作者：
Santos, Norma