siRecords: a database of mammalian RNAi experiments and efficacies.
siRecords: a database of mammalian RNAi experiments and efficacies.
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DOI：
10.1093/nar/gkn817
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发表时间：
2009-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Li T
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Ren Y;Gong W;Zhou H;Wang Y;Xiao F;Li T
基于RNAi的基因沉默技术提供了一种快速且具有成本效益的方式，以易于调节的方式敲除基因的功能。近年来，这些技术在基础生物医学研究和治疗开发中的应用取得了令人兴奋的进展。然而，设计具有高效率和特异性的有效siRNA实验仍然是一项艰巨的任务。我们提出了siRecords，一个广泛的哺乳动物RNAi实验数据库，具有一致的疗效评级。这个数据库有两个目的。首先，它提供了一个大而多样的siRNA实验数据集。该数据集忠实地代表了一般的、多样化的RNAi实验实践，并允许开发更可靠的siRNA设计工具，同时很好地抑制了过拟合问题。其次，该数据库通过为实验RNAi研究人员提供有关先前针对其感兴趣的基因设计和进行的siRNA实验的功效和其他信息，直接帮助他们。目前发布的siRecords包含17192个针对5086个基因的RNAi实验的记录。
RNAi-based gene-silencing techniques offer a fast and cost-effective way of knocking down genes’ functions in an easily regulated manner. Exciting progress has been made in recent years in the application of these techniques in basic biomedical research and therapeutic development. However, it remains a difficult task to design effective siRNA experiments with high efficacy and specificity. We present siRecords, an extensive database of mammalian RNAi experiments with consistent efficacy ratings. This database serves two purposes. First, it provides a large and diverse dataset of siRNA experiments. This dataset faithfully represents the general, diverse RNAi experimental practice, and allows more reliable siRNA design tools to be developed with the overfitting problem well curbed. Second, the database helps experimental RNAi researchers directly by providing them with the efficacy and other information about the siRNAs experiments designed and conducted previously against the genes of their interest. The current release of siRecords contains the records of 17 192 RNAi experiments targeting 5086 genes.
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影响因子：
5.8
作者：
Gong, Wuming;Ren, Yongliang;Li, Tongbin
通讯作者：
Li, Tongbin
影响因子：
6.1
作者：
Cui, WW;Ning, JC;Duncan, MK
通讯作者：
Duncan, MK
影响因子：
--
作者：
Poliseno, L;Evangelista, M;Rainaldi, G
通讯作者：
Rainaldi, G
DOI：
10.1038/nrd2310
发表时间：
2007-06
期刊：
Nature reviews. Drug discovery
影响因子：
--
作者：
de Fougerolles A;Vornlocher HP;Maraganore J;Lieberman J
通讯作者：
Lieberman J
影响因子：
4.5
作者：
Inoue, Atsushi;Sawata, Shinya Y.;Taira, Kazunari
通讯作者：
Taira, Kazunari