Predicting the recombination potential of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 and Middle East respiratory syndrome coronavirus.
Predicting the recombination potential of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 and Middle East respiratory syndrome coronavirus.
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DOI：
10.1099/jgv.0.001491
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发表时间：
2020-12
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Mossman K
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Banerjee A;Doxey AC;Tremblay BJ;Mansfield MJ;Subudhi S;Hirota JA;Miller MS;McArthur AG;Mubareka S;Mossman K
严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）最近出现，导致人类广泛感染。沙特阿拉伯王国报告了SARS-CoV-2感染，中东呼吸综合征冠状病毒（MERS-CoV）引起季节性爆发，病死率约为37%。 在这里，我们表明，有一个理论上的可能性，未来的重组事件之间的SARS-CoV-2和MERS-CoV RNA。通过计算分析，我们已经确定了ORF 1ab和S基因内的同源基因组区域，可以促进重组，并分别分析了SARS-CoV-2和MERS-CoV，ACE 2和DPP 4的细胞受体的共表达模式，以确定可能促进共感染的人体解剖部位。此外，我们通过比较已知的病毒刺突蛋白-受体相互作用残基，研究了各种动物物种对MERS-CoV和SARS-CoV-2感染的可能易感性。总之，我们认为SARS-CoV-2和MERS-CoV RNA之间的重组是可能的，并敦促高风险地区的公共卫生实验室开发诊断能力，用于检测患者样本中的重组冠状病毒。
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) recently emerged to cause widespread infections in humans. SARS-CoV-2 infections have been reported in the Kingdom of Saudi Arabia, where Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV) causes seasonal outbreaks with a case fatality rate of ~37 %. Here we show that there exists a theoretical possibility of future recombination events between SARS-CoV-2 and MERS-CoV RNA. Through computational analyses, we have identified homologous genomic regions within the ORF1ab and S genes that could facilitate recombination, and have analysed co-expression patterns of the cellular receptors for SARS-CoV-2 and MERS-CoV, ACE2 and DPP4, respectively, to identify human anatomical sites that could facilitate co-infection. Furthermore, we have investigated the likely susceptibility of various animal species to MERS-CoV and SARS-CoV-2 infection by comparing known virus spike protein–receptor interacting residues. In conclusion, we suggest that a recombination between SARS-CoV-2 and MERS-CoV RNA is possible and urge public health laboratories in high-risk areas to develop diagnostic capability for the detection of recombined coronaviruses in patient samples.
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影响因子：
14.9
作者：
Kuleshov MV;Jones MR;Rouillard AD;Fernandez NF;Duan Q;Wang Z;Koplev S;Jenkins SL;Jagodnik KM;Lachmann A;McDermott MG;Monteiro CD;Gundersen GW;Ma'ayan A
通讯作者：
Ma'ayan A
具有呼肠孤病毒基因的蝙蝠衍生的假定跨家族重组冠状病毒。
影响因子：
6.7
作者：
Huang C;Liu WJ;Xu W;Jin T;Zhao Y;Song J;Shi Y;Ji W;Jia H;Zhou Y;Wen H;Zhao H;Liu H;Li H;Wang Q;Wu Y;Wang L;Liu D;Liu G;Yu H;Holmes EC;Lu L;Gao GF
通讯作者：
Gao GF
DOI：
10.1038/nrmicro.2016.81
发表时间：
2016-08
期刊：
Nature reviews. Microbiology
影响因子：
--
作者：
de Wit E;van Doremalen N;Falzarano D;Munster VJ
通讯作者：
Munster VJ
影响因子：
--
作者：
Corman VM;Muth D;Niemeyer D;Drosten C
通讯作者：
Drosten C
影响因子：
10.7
作者：
Katoh K;Standley DM
通讯作者：
Standley DM