Highly scalable generation of DNA methylation profiles in single cells.
Highly scalable generation of DNA methylation profiles in single cells.
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DOI：
10.1038/nbt.4112
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发表时间：
2018-06
影响因子：
46.9
通讯作者：
Adey AC
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Mulqueen RM;Pokholok D;Norberg SJ;Torkenczy KA;Fields AJ;Sun D;Sinnamon JR;Shendure J;Trapnell C;O'Roak BJ;Xia Z;Steemers FJ;Adey AC
我们提出了一种高度可扩展的单细胞全基因组甲基化分析方法。我们使用我们的方法，单细胞组合索引甲基化分析（sci-MET），产生3282个单细胞亚硫酸酯测序文库，读取比对率为68±8%。我们应用sci-MET来区分三种人类细胞系的混合物的细胞身份，并从小鼠皮质组织中识别兴奋性和抑制性神经元群。
We present a highly scalable assay for whole-genome methylation profiling of single cells. We use our approach, single-cell combinatorial indexing for methylation analysis (sci-MET), to produce 3,282 single-cell bisulfite sequencing libraries and achieve read alignment rates of 68 ± 8%. We apply sci-MET to discriminate the cellular identity of a mixture of three human cell lines and to identify excitatory and inhibitory neuronal populations from mouse cortical tissue.
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影响因子：
48
作者：
Vitak SA;Torkenczy KA;Rosenkrantz JL;Fields AJ;Christiansen L;Wong MH;Carbone L;Steemers FJ;Adey A
通讯作者：
Adey A
影响因子：
25
作者：
Guo, Junjie U.;Su, Yijing;Shin, Joo Heon;Shin, Jaehoon;Li, Hongda;Xie, Bin;Zhong, Chun;Hu, Shaohui;Le, Thuc;Fan, Guoping;Zhu, Heng;Chang, Qiang;Gao, Yuan;Ming, Guo-li;Song, Hongjun
通讯作者：
Song, Hongjun
单细胞甲基组鉴定哺乳动物皮质中的神经元亚型和调节元素。
DOI：
10.1126/science.aan3351
发表时间：
2017-08-11
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Luo C;Keown CL;Kurihara L;Zhou J;He Y;Li J;Castanon R;Lucero J;Nery JR;Sandoval JP;Bui B;Sejnowski TJ;Harkins TT;Mukamel EA;Behrens MM;Ecker JR
通讯作者：
Ecker JR
影响因子：
48
作者：
Angermueller C;Clark SJ;Lee HJ;Macaulay IC;Teng MJ;Hu TX;Krueger F;Smallwood S;Ponting CP;Voet T;Kelsey G;Stegle O;Reik W
通讯作者：
Reik W
影响因子：
16
作者：
Heinz S;Benner C;Spann N;Bertolino E;Lin YC;Laslo P;Cheng JX;Murre C;Singh H;Glass CK
通讯作者：
Glass CK