RNAJunction: a database of RNA junctions and kissing loops for three-dimensional structural analysis and nanodesign.
RNAJunction: a database of RNA junctions and kissing loops for three-dimensional structural analysis and nanodesign.
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RNAJuntion：一个RNA连接和接吻循环的数据库，用于三维结构分析和纳米设计。
DOI：
10.1093/nar/gkm842
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发表时间：
2008-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Shapiro, Bruce A.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Bindewald, Eckart;Hayes, Robert;Yingling, Yaroslava G.;Kasprzak, Wojciech;Shapiro, Bruce A.
我们开发了一个名为RNAJunction的数据库，其中包含RNA结构元件的结构和序列信息，如螺旋连接、内部环、凸起和环-环相互作用。我们的数据库提供了一种用户友好的方式，通过PDB代码、结构分类、序列、关键字或螺旋间角来搜索结构元素。此外，对结构数据进行了能量最小化处理。这个数据库对于分析RNA结构以及在纳米尺度上设计新的RNA结构是有用的。该数据库可通过以下网址访问：http://rnajunction.abcc.ncifcrf.gov/
We developed a database called RNAJunction that contains structure and sequence information for RNA structural elements such as helical junctions, internal loops, bulges and loop–loop interactions. Our database provides a user-friendly way of searching structural elements by PDB code, structural classification, sequence, keyword or inter-helix angles. In addition, the structural data was subjected to energy minimization. This database is useful for analyzing RNA structures as well as for designing novel RNA structures on a nanoscale. The database can be accessed at: http://rnajunction.abcc.ncifcrf.gov/
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影响因子：
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作者：
Stefan LR;Zhang R;Levitan AG;Hendrix DK;Brenner SE;Holbrook SR
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