EBI metagenomics--a new resource for the analysis and archiving of metagenomic data.
EBI metagenomics--a new resource for the analysis and archiving of metagenomic data.
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DOI：
10.1093/nar/gkt961
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发表时间：
2014-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Sansone SA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Hunter S;Corbett M;Denise H;Fraser M;Gonzalez-Beltran A;Hunter C;Jones P;Leinonen R;McAnulla C;Maguire E;Maslen J;Mitchell A;Nuka G;Oisel A;Pesseat S;Radhakrishnan R;Rocca-Serra P;Scheremetjew M;Sterk P;Vaughan D;Cochrane G;Field D;Sansone SA
宏基因组学是一个相对较新建立但迅速发展的领域，它使用高通量的下一代测序技术来表征栖息在不同生态系统（包括海洋，湖泊，土壤，苔原，植物和身体部位）的微生物群落。宏基因组学带来了许多挑战，包括数据的管理、分析、存储和共享。为了应对这些挑战，我们开发了一种新的宏基因组学资源（http：//www.ebi.ac.uk/metagenomics/），允许用户通过最先进的管道轻松提交原始核苷酸读数进行功能和分类分析，并将其自动存储（与描述性，符合标准的元数据一起）在欧洲核苷酸档案中。
Metagenomics is a relatively recently established but rapidly expanding field that uses high-throughput next-generation sequencing technologies to characterize the microbial communities inhabiting different ecosystems (including oceans, lakes, soil, tundra, plants and body sites). Metagenomics brings with it a number of challenges, including the management, analysis, storage and sharing of data. In response to these challenges, we have developed a new metagenomics resource (http://www.ebi.ac.uk/metagenomics/) that allows users to easily submit raw nucleotide reads for functional and taxonomic analysis by a state-of-the-art pipeline, and have them automatically stored (together with descriptive, standards-compliant metadata) in the European Nucleotide Archive.
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影响因子：
14.9
作者：
Haft DH;Selengut JD;Richter RA;Harkins D;Basu MK;Beck E
通讯作者：
Beck E
影响因子：
64.8
作者：
通讯作者：
--
影响因子：
14.9
作者：
Hunter S;Jones P;Mitchell A;Apweiler R;Attwood TK;Bateman A;Bernard T;Binns D;Bork P;Burge S;de Castro E;Coggill P;Corbett M;Das U;Daugherty L;Duquenne L;Finn RD;Fraser M;Gough J;Haft D;Hulo N;Kahn D;Kelly E;Letunic I;Lonsdale D;Lopez R;Madera M;Maslen J;McAnulla C;McDowall J;McMenamin C;Mi H;Mutowo-Muellenet P;Mulder N;Natale D;Orengo C;Pesseat S;Punta M;Quinn AF;Rivoire C;Sangrador-Vegas A;Selengut JD;Sigrist CJ;Scheremetjew M;Tate J;Thimmajanarthanan M;Thomas PD;Wu CH;Yeats C;Yong SY
通讯作者：
Yong SY
影响因子：
14.9
作者：
Haug K;Salek RM;Conesa P;Hastings J;de Matos P;Rijnbeek M;Mahendraker T;Williams M;Neumann S;Rocca-Serra P;Maguire E;González-Beltrán A;Sansone SA;Griffin JL;Steinbeck C
通讯作者：
Steinbeck C
Biopython：用于计算分子生物学和生物信息学的免费 Python 工具。
DOI：
10.1093/bioinformatics/btp163
发表时间：
2009-06-01
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Cock PJ;Antao T;Chang JT;Chapman BA;Cox CJ;Dalke A;Friedberg I;Hamelryck T;Kauff F;Wilczynski B;de Hoon MJ
通讯作者：
de Hoon MJ