The Mouse Genome Database genotypes::phenotypes.
The Mouse Genome Database genotypes::phenotypes.
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DOI：
10.1093/nar/gkn886
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发表时间：
2009-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Mouse Genome Database Group
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Blake JA;Bult CJ;Eppig JT;Kadin JA;Richardson JE;Mouse Genome Database Group
小鼠基因组数据库（MGD，http://www.informatics.jax.org/）整合了有关实验室小鼠的遗传，基因组和表型信息，这是研究人类生物学和疾病的主要动物模型。 MGD中的信息来自不同来源，包括科学文献和外部数据库，例如Entrezgene，Uniprot和GenBank。除了从已发表的生物医学文献和研究人员提交中策划的小鼠基因的表型等位基因信息的广泛收集外，MGI还包括序列，功能（GO）和比较信息在内的小鼠基因的全面表示。 MGD提供了一个数据挖掘平台，该平台可以基于比较基因型，表型和功能分析的转化研究假设的发展。可以通过多种方法访问MGI，包括基于Web的搜索表，基因组序列浏览器和可下载的数据库报告。可以使用Web Services提供程序化访问。此处描述的MGD的最新改进包括用于参考基因组组装的NCBI构建37的统一小鼠基因目录，以及改善了小鼠突变体和表型的表示。
The Mouse Genome Database (MGD, http://www.informatics.jax.org/), integrates genetic, genomic and phenotypic information about the laboratory mouse, a primary animal model for studying human biology and disease. Information in MGD is obtained from diverse sources, including the scientific literature and external databases, such as EntrezGene, UniProt and GenBank. In addition to its extensive collection of phenotypic allele information for mouse genes that is curated from the published biomedical literature and researcher submission, MGI includes a comprehensive representation of mouse genes including sequence, functional (GO) and comparative information. MGD provides a data mining platform that enables the development of translational research hypotheses based on comparative genotype, phenotype and functional analyses. MGI can be accessed by a variety of methods including web-based search forms, a genome sequence browser and downloadable database reports. Programmatic access is available using web services. Recent improvements in MGD described here include the unified mouse gene catalog for NCBI Build 37 of the reference genome assembly, and improved representation of mouse mutants and phenotypes.
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Eppig JT;Blake JA;Bult CJ;Kadin JA;Richardson JE;Mouse Genome Database Group
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