Multiple novel astrovirus species in human stool.
Multiple novel astrovirus species in human stool.
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DOI：
10.1099/vir.0.014449-0
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发表时间：
2009-12
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Delwart E
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Kapoor A;Li L;Victoria J;Oderinde B;Mason C;Pandey P;Zaidi SZ;Delwart E
腹泻仍然是发展中国家发病率和死亡率的重要原因，其中许多病例仍然没有确定的病因。星状病毒是最近确定的动物胃肠炎的原因，目前包括两种怀疑引起人类腹泻的物种。使用病毒宏基因组学和泛星状病毒RT-PCR的组合，我们分析了来自不同大陆的人粪便样品的星状病毒相关RNA序列。我们鉴定了两种已知的人类星状病毒种的变体，以及基于遗传距离标准的三种新的星状病毒种，它们都与水貂和绵羊星状病毒有较远的亲缘关系，我们暂时将其命名为HMOAstV种A至C。A种的全基因组显示了哺乳动物星状病毒的所有保守特征。目前在人类粪便中发现的三组星状病毒（HAstV、AstV-MLB、HMOAstV）中的每一组与动物星状病毒的关系比彼此之间的关系更密切，这表明人类星状病毒可能周期性地从人畜共患传播中出现。基于它们在动物中最接近的系统发育亲属的致病性影响，有必要进一步调查迄今在尼日利亚、尼泊尔和巴基斯坦检测到的HMOAstV在人类胃肠炎中的作用。
Diarrhea remains a significant cause of morbidity and mortality in developing countries where numerous cases remain without identified etiology. Astroviruses are a recently identified cause of animal gastroenteritis which currently includes two species suspected of causing human diarrhea. Using a combination of viral metagenomics and pan-astrovirus RT-PCR we analyzed human stools samples from different continents for astrovirus related RNA sequences. We identified variants of the two known human astrovirus species plus, based on genetic distance criteria, three novel astrovirus species all distantly related to mink and ovine astroviruses which we provisionally named HMOAstV species A through C. A complete genome of species A displayed all the conserved characteristics of mammalian astroviruses. Each of the now three groups of astroviruses found in human stool (HAstV, AstV-MLB, HMOAstV) being more closely related to animal astroviruses than to each other indicates that human astroviruses may periodically emerge from zoonotic transmissions. Based on the pathogenic impact of their closest phylogenetic relatives in animal further investigations of the role of HMOAstV, so far detected in Nigeria, Nepal and Pakistan, in human gastroenteritis are warranted.
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影响因子：
3.3
作者：
Smith, Joseph A.;Wellehan, James F. X., Jr.;Terio, Karen A.
通讯作者：
Terio, Karen A.
影响因子：
5
作者：
Jonassen, CM;Jonassen, TO;Grinde, B
通讯作者：
Grinde, B
影响因子：
8.8
作者：
Jin, Yu;Cheng, Wei-xia;Duan, Zhao-jun
通讯作者：
Duan, Zhao-jun
影响因子：
5.4
作者：
MARCZINKE, B;BLOYS, AJ;BRIERLEY, I
通讯作者：
BRIERLEY, I
DOI：
10.1590/s0074-02762007005000032
发表时间：
2007-06-01
期刊：
Memórias do Instituto Oswaldo Cruz
影响因子：
--
作者：
Gabbay, Yvone B;Linhares, Alexandre C;Leite, José Paulo G
通讯作者：
Leite, José Paulo G