A chromosome-level reference genome assembly of the Reeve's moray eel (Gymnothorax reevesii).
A chromosome-level reference genome assembly of the Reeve's moray eel (Gymnothorax reevesii).
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DOI：
10.1038/s41597-023-02394-7
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发表时间：
2023-07-29
期刊：
影响因子：
9.8
通讯作者：
Lin, Li
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Zhang, Kai;Huang, Yu;Zhang, Yuxuan;Liang, Rishen;Li, Qingqing;Li, Ruihan;Zhao, Xiaomeng;Bian, Chao;Chen, Yongnan;Wu, Jinhui;Shi, Qiong;Lin, Li
海鳗是分布于地球仪珊瑚礁中的一类顶级捕食者，由于其潜在的敌对行为和难以捕捉的栖息地，一直没有得到很好的研究。在这里，我们构建了一个染色体水平的基因组组装的代表性里夫的海鳗（裸胸reevesii）。该单倍型基因组组装长度为2.17 Gb，97.87%的序列锚定在21条染色体上。它包含56.34%的重复序列和23，812个蛋白质编码基因，其中96.77%是功能注释。这一已测序的鳗形目海洋物种是对鳗鱼基因组遗传资源的一个很好的补充。它不仅为深入研究海鳗提供了遗传资源，而且可以进行不同鳗鱼之间的深入基因组比较。
Due to potentially hostile behaviors and elusive habitats, moray eels (Muraenidae) as one group of apex predators in coral reefs all across the globe have not been well investigated. Here, we constructed a chromosome-level genome assembly for the representative Reeve’s moray eel (Gymnothorax reevesii). This haplotype genome assembly is 2.17 Gb in length, and 97.87% of the sequences are anchored into 21 chromosomes. It contains 56.34% repetitive sequences and 23,812 protein-coding genes, of which 96.77% are functionally annotated. This sequenced marine species in Anguilliformes makes a good complement to the genetic resource of eel genomes. It not only provides a genetic resource for in-depth studies of the Reeve’s moray eel, but also enables deep-going genomic comparisons among various eels.
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