Decoding the olfactory map through targeted transcriptomics links murine olfactory receptors to glomeruli.
Decoding the olfactory map through targeted transcriptomics links murine olfactory receptors to glomeruli.
复制标题
DOI：
10.1038/s41467-022-32267-3
复制
发表时间：
2022-09-01
影响因子：
16.6
通讯作者：
Matsunami, Hiroaki
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Zhu, Kevin W.;Burton, Shawn D.;Nagai, Maira H.;Silverman, Justin D.;de March, Claire A.;Wachowiak, Matt;Matsunami, Hiroaki
嗅觉系统中的感觉处理跨嗅球肾小球组织，其中表达相同嗅觉受体的外周感觉神经元的轴突共同终止以将受体特异性活性传递到中枢神经元。因此，了解受体如何映射到肾小球对于理解嗅觉至关重要。高通量空间转录组学是一个快速发展的领域，但肾小球内低丰度的嗅觉受体表达先前排除了小鼠肾小球受体的高通量映射。在这里，我们结合了顺序切片沿着前后，背腹，和mediolateral轴与目标捕获富集测序，以克服低丰度的目标表达。这一策略使我们能够在空间上映射86%的嗅觉受体在嗅球和发现OR序列和肾小球位置之间的关系。靶向空间转录组学将嗅觉受体mRNA映射到小鼠嗅球的部分，以生成肾小球位置的交互式、统计学、3D模型并识别超敏感受体与气味剂的关系。
Sensory processing in olfactory systems is organized across olfactory bulb glomeruli, wherein axons of peripheral sensory neurons expressing the same olfactory receptor co-terminate to transmit receptor-specific activity to central neurons. Understanding how receptors map to glomeruli is therefore critical to understanding olfaction. High-throughput spatial transcriptomics is a rapidly advancing field, but low-abundance olfactory receptor expression within glomeruli has previously precluded high-throughput mapping of receptors to glomeruli in the mouse. Here we combined sequential sectioning along the anteroposterior, dorsoventral, and mediolateral axes with target capture enrichment sequencing to overcome low-abundance target expression. This strategy allowed us to spatially map 86% of olfactory receptors across the olfactory bulb and uncover a relationship between OR sequence and glomerular position. Targeted spatial transcriptomics mapped olfactory receptor mRNAs to sections of the murine olfactory bulb to generate an interactive, statistical, 3D model of glomeruli locations and identify an ultra-sensitive receptor-odorant relationship.
登录
查看更多内容
影响因子：
19
作者：
Buxbaum AR;Yoon YJ;Singer RH;Park HY
通讯作者：
Park HY
影响因子：
46.9
作者：
Becht, Etienne;McInnes, Leland;Newell, Evan W.
通讯作者：
Newell, Evan W.
影响因子：
2.9
作者：
ASTIC, L;SAUCIER, D;HOLLEY, A
通讯作者：
HOLLEY, A
影响因子：
16.2
作者：
Friedrich, RW;Korsching, SI
通讯作者：
Korsching, SI
影响因子：
56.9
作者：
Imai, Takeshi;Suzuki, Misao;Sakano, Hitoshi
通讯作者：
Sakano, Hitoshi