Structure, evolution and function of the bi-directionally transcribed iab-4/iab-8 microRNA locus in arthropods.
Structure, evolution and function of the bi-directionally transcribed iab-4/iab-8 microRNA locus in arthropods.
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DOI：
10.1093/nar/gks1445
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发表时间：
2013-03-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Ronshaugen M
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Hui JH;Marco A;Hunt S;Melling J;Griffiths-Jones S;Ronshaugen M
在黑腹果蝇中，iab-4/iab-8基因座编码双向转录的microrna，调控侧翼Hox转录因子的功能。研究结果表明，iab-4/iab-8基因座的双向转录、时空表达模式和Hox调控功能在苍蝇和甲虫Tribolium castaneum之间是保守的。计算预测表明，iab-4和iab-8 microrna可以靶向共同的位点，细胞培养实验证实，iab-4和iab-8的功能在苍蝇和甲虫的Hox靶点上重叠。然而，我们观察到Hox基因靶向方式的关键差异。例如，在果蝇中，abd-A转录本仅被iab-8靶向，而iab-4和iab-8都与Tribolium abd-A结合。我们对一个双向转录的microRNA的进化和功能表征，建立了iab-4/iab-8系统作为一个模型，用于理解来自正义和反义microRNA的多种产物如何靶向共同位点。
In Drosophila melanogaster, the iab-4/iab-8 locus encodes bi-directionally transcribed microRNAs that regulate the function of flanking Hox transcription factors. We show that bi-directional transcription, temporal and spatial expression patterns and Hox regulatory function of the iab-4/iab-8 locus are conserved between fly and the beetle Tribolium castaneum. Computational predictions suggest iab-4 and iab-8 microRNAs can target common sites, and cell-culture assays confirm that iab-4 and iab-8 function overlaps on Hox target sites in both fly and beetle. However, we observe key differences in the way Hox genes are targeted. For instance, abd-A transcripts are targeted only by iab-8 in Drosophila, whereas both iab-4 and iab-8 bind to Tribolium abd-A. Our evolutionary and functional characterization of a bi-directionally transcribed microRNA establishes the iab-4/iab-8 system as a model for understanding how multiple products from sense and antisense microRNAs target common sites.
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DOI：
10.1186/1758-907x-3-8
发表时间：
2012-09-27
期刊：
Silence
影响因子：
--
作者：
Marco A;Macpherson JI;Ronshaugen M;Griffiths-Jones S
通讯作者：
Griffiths-Jones S
影响因子：
14.9
作者：
Kozomara A;Griffiths-Jones S
通讯作者：
Griffiths-Jones S
影响因子：
4.4
作者：
Legeai F;Rizk G;Walsh T;Edwards O;Gordon K;Lavenier D;Leterme N;Méreau A;Nicolas J;Tagu D;Jaubert-Possamai S
通讯作者：
Jaubert-Possamai S
影响因子：
64.5
作者：
Rinn, John L.;Kertesz, Michael;Chang, Howard Y.
通讯作者：
Chang, Howard Y.
影响因子：
4.4
作者：
Liu S;Li D;Li Q;Zhao P;Xiang Z;Xia Q
通讯作者：
Xia Q