The complete nucleotide sequence of chloroplast genome of Euphorbia kansui (Euphorbiaceae), an endemic herb in China.
The complete nucleotide sequence of chloroplast genome of Euphorbia kansui (Euphorbiaceae), an endemic herb in China.
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DOI：
10.1080/23802359.2018.1495122
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发表时间：
2018-08-01
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Li ZH
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Liu ML;Fan WB;Wu Y;Wang YJ;Li ZH
甘遂是大戟科植物甘遂的一种多年生草本植物，中国特有。本种具有重要的经济和药用价值。在这项研究中，我们首先利用Illumina HiSeq平台测定了甘遂棘豆叶绿体(Cp)基因组的完整核苷酸序列。CP基因组全长161,061 ，由91,288 的大单复制区、17,086 的小单复制区和26,343 的两个反向重复序列组成。CP基因组包含130个基因，包括86个蛋白质编码基因、8个核糖体RNAs(RRNAs)和36个转移RNAs(TRNAs)。系统发育分析表明，甘遂与同属的大戟属为姊妹种。
Euphorbia kansui T.N. Liou ex S.B. Ho (Euphorbiaceae) is a perennial herb plant endemic to China. This species has important economic and medicinal values. In this study, we first characterized the complete nucleotide sequence of chloroplast (cp) genome of E. kansui using the Illumina Hiseq platform. The cp genome was 161,061 bp in length, comprising of a large single copy (LSC) region of 91,288 bp, a small single copy (SSC) region of 17,086 bp, and two inverted repeat regions of 26,343 bp each. The cp genome contains 130 genes, including 86 protein-coding genes, 8 ribosomal RNAs (rRNAs), and 36 transfer RNAs (tRNAs). The phylogenetic analysis indicated that E. kansui was placed as a sister to the congeneric Euphorbia esula.
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