Molekulare Modellierung der Bindung von Peptiden und Proteinen an Oxidkeramikoberflächen

肽和蛋白质与氧化物陶瓷表面结合的分子模拟

• 批准号: 112803434
• 负责人: Professor Dr. Jürgen Pleiss
• 金额: --
• 依托单位: Abteilung für Technische Biochemie
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2008-12-31 至 2011-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/112803434?language=en
• 关键词: Molekulare; Modellierung; der; Bindung; von

Im Rahmen des vorgeschlagenen Projekts sollen die molekularen Mechanismen der Bindung von synthetischen Peptiden und natürlichen Proteindomänen an oxidkeramische Oberflächen untersucht werden. Die Struktur von Peptiden an einer oxidkeramischen Oberfläche und deren Wechselwirkungen werden durch molekulardynamische Simulationen möglichst realistischer Systeme untersucht: die keramische Oberfläche wird in atomarer Auflösung beschrieben, die organische Matrix wird durch mehrere Schichten von Peptiden dargestellt, und das Lösungsmittel wird explizit berücksichtigt. Da die Peptide sehr flexibel sind, wird erwartet, dass ihre bevorzugte Konformation von der Wechselwirkung mit der Oberfläche, anderen Peptidmolekülen, Additiven wie zum Beispiel Sacchariden sowie dem Lösungsmittel bestimmt ist. Neben Strukturinformationen sollen mit Hilfe einer Simulation dieses Systems die Bindungsaffinität der Peptide an die Oberfläche ermittelt werden. Die maximale Kraft, die zur Ablösung von der Oberfläche benötigt wird, geht dann als Parameter in die Simulationen des Verformungs- und Versagensverhaltens ein (TP 5). Durch eine Modellierung verschiedener Peptide sollen außerdem Peptidsequenzen vorhergesagt werden, die zu einer erhöhten Bindung führen. Die Eigenschaften dieser Peptide werden dann experimentell überprüft (EMC microcollections GmbH, TP 3). In das Design neuer Peptide gehen außerdem die Ergebnisse einer detaillierten Analyse der in verschiedenen Organismen identifizierten mineralbindenden Proteindomänen ein. Zur Erfassung von Literaturdaten und Sequenzdaten der Projektpartner (TP 1, 2 und 3) werden familienspezifische Proteindatenbanken erstellt, die einen systematischen Sequenzvergleich und eine Strukturmodellierung ermöglichen.

我是Rahman des vorgeschlagenen Projekts Sollen die Molekularen机械师和Bindung von Synthetischen Peptiden and natürlichen Proteindonänen an Oxkeramische OberfläChen untersuht den。这是一个非常重要的问题，这是一个非常重要的问题，因为这是一个非常重要的问题，因为这是一个非常重要的问题，因为它是一个非常重要的问题，它是一个非常重要的问题。多肽是一种灵活的多肽，它是我们的理想选择，也是我们的理想之选，也是我们的理想之选，更重要的是，我们将为您服务。Nben StrukturInformation en Sollen MIT Hilfe einer模拟系统与多肽和Oberfläche ermittelt的系统。最大牛皮纸，最大牛皮纸，最大牛皮纸。您的位置：我也知道>教育/科学>教育/职业教育/科学教育/科学/教育/科学/教育/科学等领域。Die Eigenschaften Dieser多肽是Dann Examentellüberprüft(EMC MicroCollection GmbH，TP 3)。在DAS设计中，Neuer多肽在Verschiedenen组织中进行了详细的分析，以确定矿物质结合蛋白。项目合作伙伴(TP 1、2和3)的Zur Erfassung和Sequenzdaten(TP 1、2和3)熟悉ProteindatenBanken erstellt、Die einen Systatischen Sequenzvergleich and eine StrukturModel lierung ermöglichen。