Collaborative proposal: NCR-circuit dynamics
合作提案:NCR 电路动力学
基本信息
- 批准号:0443863
- 负责人:
- 金额:--
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:Standard Grant
- 财政年份:2005
- 资助国家:美国
- 起止时间:2005-05-15 至 2009-04-30
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
Using a combinatorial decomposition of a genetic regulatory network into sub-networks and harnessing the versatility of yeast to encode each of these as a separate strain, this research will dissect, deconvolve and decipher the dynamics of nitrogen catabolite repression. Based on detailed measurements using transcription factor fusion proteins, live cell imaging, and quantitative measurement of transcription rate, the investigors will develop precise models of the dynamical behavior of the complex yeast network. Quantitative models will provide a platform for for the discovery of mathematical theorems, that relate the structure of genetic circuits to their dynamics and function. This theory in turn will allow a study of the robustness of the circuit with respect to parameters and its output. The mathematical theory that will be developed will, among other things, allow researchers to streamline simulations of large biological networks. In recent years there has been a growing awareness of the connections between biological organisms and engineering systems. There are networks of genes that control and regulate the behavior of other genes and ultimately all biological processes. These networks of genes are analogous to electrical circuits and switches. There has been an expanding willingness and desire to use mathematical and computational techniques to leverage all existing information regarding the structure of biological control circuitry to understand the basic rules on which they are predicated and to acquire the ability to predict their output. Understanding the dynamics of such networks promises revolutionary changes in the treatment of human diseases as well as providing insight for the development of a new generations of robust electronic and digital devices. This project will have a significant impact on graduate education and on recruitment of mathematics graduate students for interdisciplinary scientific work as well as the recruitment of biology, computer science and medical students into the interdisciplinary and emerging field of biomedical informatics.
利用遗传调控网络的组合分解为子网络,并利用酵母的多功能性将每个子网络编码为单独的菌株,这项研究将剖析、去卷积和破译氮分解代谢抑制的动力学。基于使用转录因子融合蛋白、活细胞成像和转录速率定量测量的详细测量,研究人员将开发复杂酵母网络动态行为的精确模型。定量模型将为发现数学定理提供一个平台,这些数学定理将遗传电路的结构与其动力学和功能联系起来。这一理论反过来将允许研究电路相对于参数及其输出的稳健性。即将开发的数学理论将使研究人员能够简化大型生物网络的模拟。近年来,人们越来越意识到生物有机体和工程系统之间的联系。有基因网络控制和调节其他基因的行为,并最终控制所有的生物过程。这些基因网络类似于电路和开关。越来越多的人愿意并希望利用数学和计算技术来利用关于生物控制电路结构的所有现有信息,以了解它们所依据的基本规则,并获得预测其输出的能力。了解这种网络的动态,有望为人类疾病的治疗带来革命性的变化,并为开发新一代强大的电子和数字设备提供洞察力。该项目将对研究生教育、为跨学科科学工作招收数学研究生以及为生物医学信息学跨学科和新兴领域招收生物学、计算机科学和医学专业的学生产生重大影响。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
Tomas Gedeon其他文献
らせん渦の不安定化過程の直接数値シミュレーション
螺旋涡失稳过程的直接数值模拟
- DOI:
- 发表时间:
2020 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
William Duncan;Tomas Gedeon;Hiroshi Kokubu;Konstantin Mischaikow;Hiroe Oka,;服部裕司 - 通讯作者:
服部裕司
ガンマ線バーストを用いた初期宇宙・極限時空探査計画 HiZ-GUNDAM
HiZ-GUNDAM,利用伽马射线爆发的早期宇宙和极限时空探索项目
- DOI:
- 发表时间:
2023 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
William Duncan;Tomas Gedeon;Hiroshi Kokubu;Konstantin Mischaikow;Hiroe Oka,;服部裕司;米徳大輔 - 通讯作者:
米徳大輔
遺伝子制御ネットワーク系のモース分解について
基因调控网络系统的莫氏分解
- DOI:
- 发表时间:
2019 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Tomas Gedeon;Shaun Harker;Hiroshi Kokubu;Konstantin Mischaikow;Hiroe Oka;Hiroe Oka - 通讯作者:
Hiroe Oka
GRAS-Di法によるオオムギ遺伝資源のゲノム多様性解析
利用GRAS-Di方法分析大麦遗传资源的基因组多样性
- DOI:
- 发表时间:
2019 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Tomas Gedeon;Shaun Harker;Hiroshi Kokubu;Konstantin Mischaikow;Hiroe Oka;最相 大輔,榎 宏征,鈴木 一代 - 通讯作者:
最相 大輔,榎 宏征,鈴木 一代
Conley Indices for continuous and discrete time dynamical systems
连续和离散时间动力系统的康利指数
- DOI:
- 发表时间:
2018 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Tomas Gedeon;Shaun Harker;Hiroshi Kokubu;Konstantin Mischaikow;Hiroe Oka;Hiroe Oka;Hiroe Oka;Hiroe Oka - 通讯作者:
Hiroe Oka
Tomas Gedeon的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('Tomas Gedeon', 18)}}的其他基金
Collaborative Research: Mechanistic Models of Cooperative Biopolymerization Processes
合作研究:协同生物聚合过程的机理模型
- 批准号:
1951510 - 财政年份:2020
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Continuing Grant
Tripods+X:Res: Collaborative Research: Identification of Gene Regulatory Network Function from Data
Tripods X:Res:协作研究:从数据中识别基因调控网络功能
- 批准号:
1839299 - 财政年份:2018
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Standard Grant
Emergent properties of synthetic microbial consortia
合成微生物群落的新兴特性
- 批准号:
1361240 - 财政年份:2014
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Standard Grant
Dynamics and synchronization of biochemical oscillators
生化振荡器的动力学和同步
- 批准号:
0818785 - 财政年份:2008
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Standard Grant
Fluid-Structure Interaction in Arthropod Mechanoreceptors with Application to Bio-Inspired Micro-Fluidic Sensors
节肢动物机械感受器中的流固相互作用及其在仿生微流体传感器中的应用
- 批准号:
0849433 - 财政年份:2008
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Standard Grant
International Conference: Mathematical tools for multi-scale biological processes, June 2008. Bozeman, MT
国际会议:多尺度生物过程的数学工具,2008 年 6 月。博兹曼,MT
- 批准号:
0803127 - 财政年份:2008
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Standard Grant
Mathematical Sciences: "Analog Neural Networks and Delay Equations".
数学科学:“模拟神经网络和延迟方程”。
- 批准号:
9622722 - 财政年份:1996
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Standard Grant
相似海外基金
RESEARCH PROPOSAL What is your project title? Development of additive manufactured polymeric seals for low molecular weight gases
研究计划 您的项目名称是什么?
- 批准号:
2908868 - 财政年份:2024
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Studentship
Development of a low-pressure loss air purification device using rotating porous media and a proposal for its use in ventilation systems
使用旋转多孔介质的低压损失空气净化装置的开发及其在通风系统中的使用建议
- 批准号:
24K17404 - 财政年份:2024
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Proposal Title : NemeSys - Smart Multiphasic Nanoreactors Based On Tailored Foams for Direct H2O2 Synthesis
提案标题:NemeSys - 基于定制泡沫的智能多相纳米反应器,用于直接合成 H2O2
- 批准号:
EP/Y034392/1 - 财政年份:2024
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Research Grant
Conference: Supporting Mentoring in STEM Graduate Education: A Proposal for Virtual Workshops and Supporting Activities
会议:支持 STEM 研究生教育辅导:虚拟研讨会和支持活动的提案
- 批准号:
2413980 - 财政年份:2024
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Standard Grant
Collaborative Research: Time-Sharing Experiments for the Social Sciences (TESS): Proposal for Renewed Support, 2020-2023
合作研究:社会科学分时实验(TESS):2020-2023 年更新支持提案
- 批准号:
2424057 - 财政年份:2024
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Continuing Grant
CRCNS US-German Collaborative Research Proposal: Neural and computational mechanisms of flexible goal-directed decision making
CRCNS 美德合作研究提案:灵活目标导向决策的神经和计算机制
- 批准号:
2309022 - 财政年份:2024
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Standard Grant
Travel: Texas Power and Energy Conference (TPEC) 2024 Travel Proposal
旅行:德克萨斯州电力与能源会议 (TPEC) 2024 年旅行提案
- 批准号:
2341300 - 财政年份:2024
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Standard Grant
Business and Local Government Data Research Centre Legacy Status Proposal
企业和地方政府数据研究中心遗留状态提案
- 批准号:
ES/Y003411/1 - 财政年份:2024
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Research Grant
Lite(House) - A Financially Flexible, Adaptive and Efficient Live/Work Housing Proposal
Lite(House) - 财务灵活、适应性强且高效的生活/工作住房提案
- 批准号:
10071140 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Collaborative R&D
Proposal of effective utilization of polyphenols as functional food ingredients for realization of a healthy longevity society
有效利用多酚作为功能性食品成分以实现健康长寿社会的提案
- 批准号:
23K10889 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)