Charakterisierung meiotischer Hot Spots für nicht-allelische homologe Rekombination (NAHR)

非等位同源重组 (NAHR) 减数分裂热点的表征

• 批准号: 203686107
• 负责人: Professorin Dr. Hildegard Kehrer-Sawatzki
• 金额: --
• 依托单位: Institut für Humangenetik
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2010-12-31 至 2013-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/203686107?language=en
• 关键词: Charakterisierung; meiotischer; Hot; Spots; nicht

Meiotische Rekombination zwischen hoch homologen duplizierten Sequenzen verursacht rekurrente Deletionen und Duplikationen, die unterschiedliche Erkrankungen bzw. Syndrome des Menschen verursachen. Diese aberrante Rekombination wird auch nicht-allelische homologe Rekombination (NAHR) genannt. Trotz der großen Bedeutung von NAHR als mutagenem Mechanismus sind die Ursachen und Eigenschaften von NAHR im menschlichen Genom nur unzureichend erforscht. Ein Grund hierfür liegt in der komplexen Sequenz-Variation der duplizierten Sequenzen (low-copy repeats, LCRs), welche die Substrate für NAHR darstellen. Diese komplexe Sequenz-Variation erschwert die Analyse von NAHR-Bruchpunkten. Die genaue Kenntnis dieser Sequenz-Diversität zwischen den beteiligten LCRs ist die Grundlage für die Analyse von NAHR-Bruchpunkten. Es gibt Hinweise dafür, dass NAHR-Bruchpunkte in LCRs nicht zufällig verteilt sind sondern gehäuft in Hot Spots von 500-Bp bis 2-Kb auftreten. Mit diesem Projekt möchten wir die Eigenschaften solcher NAHR-Hot Spots für Genom-Rearrangements am Beispiel rekurrenter NF1 Deletionen untersuchen. Von einem Vergleich mit anderen NAHR-Bruchpunkten erwarten wir Erkenntnisse über die Ursachen und genetischen Determinanten NAHR-vermittelter Rearrangements im menschlichen Genom insbesondere die Sequenzen, die zu NAHR prädisponieren.

同源重复序列的重组可导致缺失和重复，从而导致不确定的结果。人的畸形综合征。这种变异的重组也不会产生等位基因同源重组（NAHR）。NAHR的大部分突变机制是人类基因组中NAHR的Ursachen和Eigenschaften努尔unzureichend erescht。Ein Grund hierfür liegt in der komplexen Sequenz-Variation der duplicizierten Sequenzen（low-copy repeats，LCR），welche die Substrate für NAHR darstellen.该复杂序列变异用于NAHR-Bruchpunkten的分析。一般的知识是对LCR进行更好的序列多样性分析，这是NAHR-Bruchpunkten分析的基础。由于Hinweise dafür，dass NAHR-Bruchpunkte in LCR nicht zufällig vertilt sind sondern gehäuft in Hot Spots von 500-Bp bis 2-Kb auftreten. Mit diesem Projekt möchten wir die Eigenschaften solcher NAHR-Hot Spots für Genom-Rearrangements am Beispiel rekurrenter NF1 Deletionen untersuchen.通过与NAHR-Bruchpunkten的比较，我们可以发现在测序过程中基因组重排的结果和遗传学决定因素。

项目成果

Characterization of the nonallelic homologous recombination hotspot PRS3 associated with type‐3 NF1 deletions

与 3 型 NF1 缺失相关的非等位基因同源重组热点 PRS3 的表征

• DOI: 10.1002/humu.21644
• 发表时间: 2012
• 期刊: Human Mutation
• 影响因子: 3.9
• 作者: Zickler AM;Hampp S;Messiaen L;Bengesser K;Mussotter T;Roehl AC;Wimmer K;Mautner VF;Kluwe L;Upadhyaya M;Pasmant E;Chuzhanova N;Kestler HA;Högel J;Legius E;Claes K;Cooper DN;Kehrer-Sawatzki H
• 通讯作者: Kehrer-Sawatzki H