Functional analysis of Hammerhead Ribozymes from plants

植物锤头核酶的功能分析

• 批准号: 21317325
• 负责人: Professor Dr. Christian Hammann
• 金额: --
• 依托单位: HMU Health and Medical University Potsdam
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2005-12-31 至 2009-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/21317325?language=en
• 关键词: Functional; analysis; Hammerhead; Ribozymes; plants

Das Hammerhead Ribozyme (HHRz) ist ein kleines RNA Motiv mit spezifischer Spaltungsund Ligationsaktivität, die von zweiwertigen Metallionen abhängt. Wir haben diese Motive in A. thaliana als erstem Pflanzengenom gefunden und Expression und Spaltung in mehreren Geweben gezeigt. In diesem Projekt wollen wir diese HHRzs detailliert biochemisch und funktioneil untersuchen. Thermodynamische Parameter and die Stöchiometrie der Mg2+ Bindung sollen durch Kalorimetrie bestimmt werden, und mit HHRzs aus Viroiden vergleichen werden, um Unterschiede in der Aktivität zu erklären. Wir haben Spaltung in Viroid Varianten gezeigt, obwohl diese nicht den publizierten Sequenzanforderungen genügen. Diese Varianten sollen zusätzlich kinetisch charakterisiert, und ihre Metallionen Bindung untersucht werden. Die Arabidopsis HHRzs sollen auf subzelluläre Lokalisation, Gewebespezifität und eine Regulation ihrer Expression durch Licht untersucht werden. Dies soll mit der Expression der putativen Ziel mRNA verglichen werden, gegen die die HHRzs in antisense Orientierung liegen. In vivo Analysen, z.B. Knock-down durch siRNAs und Herstellung homozygoter Knock-out Linien, werden im kooperierenden Labor von D. Staiger durchgeführt. Schließlich soll der evolutionäre Ursprung der Pflanzen HHRz durch Southern Blot Analysen an einer Vielzahl an Genomen untersucht werden. Sequenzen aus neuen Pflanzen sollen kloniert und in vitro charakterisiert werden.

Das Hammerhead Ribozyme(HHRz)是Kleines RNA基序中的Spaltungscher Spaltungsund Ligationsaktiität，die von zweiwertigen Metallionen abhängt。我们在拟南芥中发现了死亡动机，并在Mehreren Geweben gezeigt中表达和Spaltung。在Diesem Projekt Wollen Wir Diese中，HHRzs详细介绍了生物化学和功能。热力学参数和热力学参数与热力参数的关系，以及MIT HHRzs Aus Viroiden vergleichen，Um Unterschiede in der Aktitiität zu zu Erklären。我们在病毒库中找到了自己的名字，并发表了自己的观点。这是一种特殊的行为方式，也是一种特殊的行为方式。拟南芥HHRzs Sollen auf subzelluläre LOKIZATION，Gewebespezifität and eine Reguling iHer Remory LICHIT UNTERSIGHHT DEN。在反义东方体基因中，ZIIR基因表达缺失，HHRzs基因缺失。在活体分析中，Z.B.敲除的siRNA和Herstellung纯合子敲除Linien，被称为Koperierenden劳工von D.Staiger duchgefüHRT。Schlie？lich soll der进化äre Ursprung der Pflanzen HHRz Durch Southern Blot Analysen an einer Vielzahl an Genomen Untersuht den.Sequenzen Aus neuen Pflanzen Sollen kLoniert和体外特征。