Simulationen und Multiskalenmodellierung von multivalenten Zucker-Protein-Wechselwirkungen (C09)

多价糖-蛋白质相互作用的模拟和多尺度建模（C09）

• 批准号: 226757776
• 金额: --
• 依托单位: Institut für Theoretische Physik
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Collaborative Research Centres
• 财政年份: 2012
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2011-12-31 至 2018-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/226757776?language=en
• 关键词: Simulationen; und; Multiskalenmodellierung; von; multivalenten

Für die Modellierung multivalenter Wechselwirkungen nutzen wir eine Kombination aus Moleküldynamik-Simulationen, coarse-grained Simulationen und analytischen Multiskalenmodellen. Mit den in der letzten Förderperiode entwickelten Methoden sollen multivalente Sialinsäure-basierte Liganden zur Bindung an Influenza-Hämagglutinin optimiert werden. Mit unserem optimierten atomistischen Polyglycerol (PG) Kraftfeld soll das elastische und osmotische Quellverhalten von hyperverzweigtem PG quantifiziert und die Wechselwirkung zwischen PG-Nanopartikeln und Viren bestimmt werden. Außerdem sollen die Wechselwirkungen zwischen verschiedensten funktionalisierten planaren Oberflächen in Anwesenheit von Wasser berechnet werden um so die an eine gegebene pathogene Oberfläche optimal bindende synthetische Oberfläche vorherzusagen.

Für die Modellierung multivalenter Wechselkungen nutzen wir eine Combination aus Moleküldynamik-Simulationen，coarse-grained Simulationen und analytischen Multiskalenmodellen. Mit den in der letzten Förderperiode entwickelten Methoden sollen multivalente Sialinsäure-basierte Liganden zur Bindung an Influenza-Hämagampus in optimiert韦尔登.通过对聚甘油（PG）进行原子化优化，Kraftfeld可对超重PG进行定量，并对PG-纳米粒子和Viren进行韦尔登。在瓦塞尔的韦尔登的Anwesenchum中，我们解决了Wechselfenkungen zwischen verktionalisierten planaren Oberflächen问题，从而形成了一种最佳的综合Oberfläche pathogene Oberfläche bindende Oberfläche vorherzusagen。