Bioinformatik und Modellierung

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Im Rahmen der beantragten DFG Forschergruppe werden systematisch Daten zur Struktur, zum Stoffwechsel und zur Gen- und Proteinexpression des Muskels im Schwein mit Techniken der funktionellen Genomanalyse erhoben, die mit phänotypischen Merkmalen sowie Fleischqualitätsparametern, hier insbesondere dem Wasserbindungsvermögen (WBV), assoziiert sind. Dieses Teilprojekt bündelt die Ressourcen des Projektverbundes und befasst sich mit der Integration, dem Austausch und der Darstellung sowie der Analyse der Daten aus den verschiedenen Arbeitsgruppen. Dabei wird ein dreistufiger Ansatz zur funktionellen Charakterisierung der zugrunde liegenden biologischen Prozesse sowie zur Detektion von relevanten Markergenen (Targets) verfolgt:1. Die Entwicklung eines flexiblen Datenintegrationsschemas, in das die verschiedenenexperimentellen Techniken abgebildet werden.2. Die Analyse und Korrelation der Daten mit state-of-the-art Techniken und Methoden derBioinformatik zur Identifizierung von molekularen Targets, die mit dem WBV assoziiert sind.3. Die Modellierung und Simulation zur in silico Validierung der detektierten Bio-Marker imKontext der relevanten Pathways.