The evolution of repetitive DNA and its methylation (C09*)

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Alu Retrotransposons sind parasitäre DNA Elemente, die sich durch reverse Transkription ihrer RNA-Produkte vermehren und schnell evolvieren. Wir werden die evolutionäre Fitness verschiedener Alu Sequenzvarianten anhand ihrer Genom-Reintegrationsraten messen. Durch die Kombination phylogenetischer Daten mit DNA Methylierungs-, Transkriptom- und Chromatin-Immunopräzipitationsdaten werden wir den Einfluss von Alu-Sequenzvariationen auf Determinanten ihrer evolutionären Fitness wie z.B. Alu-Transkription, Stabilität von Alu-Transkripten und deren Reintegrationspotential quantifizieren.