HPLC-DAD-MS zur Metabolomik-Analyse

用于代谢组学分析的 HPLC-DAD-MS

• 批准号: 260899359
• 金额: --
• 依托单位: Philipps-Universität Marburg
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Major Research Instrumentation
• 财政年份: 2014
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2013-12-31 至 无数据
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/260899359?language=en
• 关键词: HPLC; DAD; MS; zur; Metabolomik

Schwerpunkte unserer Arbeit sind die funktionelle Genomik und Metabolomik des Sekundärstoffstoffwechsels in sequenzierten Mikroorganismen, insbesondere in Pilzen der Ascomyzeten. Für die Produktion der gewünschten Substanzen, z.B. Arzneistoffe durch synthetische Biologie, sind Untersuchungen zur Biosynthese von Naturstoffen und Genfunktionen essentiell. Metabolomik hat sich in den letzten Jahren als erfolgversprechendes Verfahren zur Untersuchung des Sekundärstoffwechsels erwiesen. Um möglichst viele Metabolite aus Kulturen von Wildtyp und Transformanten unter diversen Bedingungen zu erfassen und damit Kenntnisse über Genfunktion und Genexpressionsprofile zu gewinnen, ist eine empfindliche und präzise Analyse-Methode erforderlich. Eine HPLC-Anlage gekoppelt mit einem Photodioden Array Detektor (DAD) und einem hochaufgelösten TOF-Massenspektrometer bietet ideale Voraussetzungen für diese Zwecke. Die Hochauflösung und Fragmentierung durch MSn-Experimente sind für die Identifizierung mancher Substanzen von entscheidender Bedeutung, da diese Substanzen häufig nur in sehr geringer Menge produziert werden und eine Strukturaufklärung mittels NMR-Analyse unmöglich wäre. Zusätzlich soll die beantragte Anlage zur Produktidentifizierung von Enzymassays eingesetzt werden.

Schwerpunkte unserer Arbeit sind die funktionelle Genomik und Metabolomik des Sekundärstoffstoffwechsels in sequenzierten Mikroorganismen，insbesondere in Pilzen der Ascomyzeten. Für die Produktion der gewünschten Substanzen，z.B.通过合成生物学研究药物，是研究天然药物生物合成和基因功能的重要手段。代谢组学在近几年来一直在研究可再生能源。在不同的哺乳动物中，野生型和转化体的多种代谢产物及其基因功能和基因表达谱，是一种有效和实用的分析方法。HPLC-Anlage gekoppelt mit einem Photodioden Array Detektor（DAD）and einem hochaufgelösten TOF-质谱仪bietet ideale Voraussetzungen für diese Zwecke.通过MSn-实验的Hochauflösung和Fragmentierung sind für die Identifizierung mancher Substanzen von entscheidender Bedeutung，da diese Substanzen häufig努尔in sehr geringer Menge produziert韦尔登und eine Strukturaufklärung mittels NMR-Analyse unmöglich wäre. Zusätzlich soll die beantragte Anlage zur Produktidifizierung von Enzymassays eingesetzt韦尔登。

项目成果

PrenDB, a Substrate Prediction Database to Enable Biocatalytic Use of Prenyltransferases*

PrenDB，一个底物预测数据库，可实现异戊二烯转移酶的生物催化用途*

• DOI: 10.1074/jbc.m116.759118
• 发表时间: 2017
• 期刊: The Journal of Biological Chemistry
• 作者: Jakub Gunera;Florian Kindinger;Shu-Ming Li;Peter Kolb
• 通讯作者: Peter Kolb

Convenient synthetic approach for tri- and tetraprenylated cyclodipeptides by consecutive enzymatic prenylations

• DOI: 10.1007/s00253-018-8761-7
• 发表时间: 2018-03-01
• 期刊: APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY
• 影响因子: 5
• 作者: Wohlgemuth, Viola;Kindinger, Florian;Li, Shu-Ming
• 通讯作者: Li, Shu-Ming

Expanding tryptophan-containing cyclodipeptide synthase spectrum by identification of nine members from Streptomyces strains

• DOI: 10.1007/s00253-018-8908-6
• 发表时间: 2018-05-01
• 期刊: APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY
• 影响因子: 5
• 作者: Liu, Jing;Yu, Huili;Li, Shu-Ming
• 通讯作者: Li, Shu-Ming

Production of α-keto carboxylic acid dimers in yeast by overexpression of NRPS-like genes from Aspergillus terreus

• DOI: 10.1007/s00253-017-8719-1
• 发表时间: 2018-02-01
• 期刊: APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY
• 影响因子: 5
• 作者: Huehner, Elisabeth;Backhaus, Katja;Li, Shu-Ming
• 通讯作者: Li, Shu-Ming