Systembiologische Untersuchungen und Weiterentwicklung eines mathematischen Modells TNF-induzierter zellulärer Reaktionen

系统生物学研究和 TNF 诱导细胞反应数学模型的进一步发展

• 批准号: 27645337
• 负责人: Dr. Eric Bullinger
• 金额: --
• 依托单位: Max-Planck-Institut für Dynamik komplexer technischer Systeme
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2005-12-31 至 2010-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/27645337?language=en
• 关键词: Systembiologische; Untersuchungen; und; Weiterentwicklung; eines

Mathematische Modellierung von Signaltransduktionsprozessen und Analyse dieser Modelle kann im Wechselspiel mit experimenteller Arbeit das Verständnis solcher Netzwerke enorm fördern. Bisher wurde das bisher detaillierteste Modell der Signaltransduktion des Wachstumsfaktor EGF erstellt. ... Unsere Arbeiten auf dem Gebiet der apoptotischen Signalwege gingen ebenfalls von einem extrem großen, von uns in Vorarbeiten aufgestellten Modell aus. Dieses Modell zeigte allerdings gewisse Diskrepanzen zu Experimentaldaten und dem erwarteten Systemverhalten auf, wobei eine Suche nach den Ursachen auf die Caspase-Kaskade hinwies. Daraufhin wurde ein möglichst kleines Modell der Caspase-Kaskade aus der Gesamtstruktur extrahiert, was eine stringente mathematische Analyse ermöglichte.Unter Berücksichtigung der Forderung nach Bistabilität des Systems wiesen diese Analysen auf die Notwendigkeit eines Regulators der Initiatorcaspase hin, der daraufhin in das Modell implementiert wurde (inzwischen wurden solche Regulatoren, die CARPs, auch in der Literatur beschrieben). Bei aller Einfachheit ist das so modifizierte Modell jetzt in der Lage, essentielle Zusammenhänge richtig zu beschreiben: Zum einen zeigte es sich tolerant gegenüber limitierter Initiatorcaspase-Aktivierung, d.h. dass die Effektorcaspasen erst ab einem bestimmten Schwellwert vollständig aktiviert werden. Diese sehr rasche, vollständige Aktivierung erfolgt nach einer der Stimulusstärke umgekehrt proportionalen ¿Entscheidungsphase . Damit werden auf der Einzelzellebene erhobene Experimentaldaten richtig wiedergegeben und das Modell ist in der Lage die unterschiedlichen beobachteten Kinetiken der Apoptoseinduktion an Zellpopulationen und Einzelzellen durch eine gewisse Streuung in der Stärke des Eingangssignals zu erklären. In der folgenden Förderperiode sind geplant: 1. Modellvalidierung und vergleichende Untersuchungen an unterschiedlichen Zelltypen (Typ l bzw. Typ II) durch Einzelzellexperimente mit Hilfe eines etablierten Systems der Mikroinjektion 2. Erweiterung des Modells um den mitochondrialen apoptotischen Weg und Verknüpfung mit einem der Literatur entnommenen Modell der NF-KB-Signalwege 3. Etablierung eines Modells der Ligand/Rezeptor-Interaktion. Die Arbeiten zu mitogenen Signalwegen des Wachstumsfaktors EGF konzentrierten sich daher auf theoretische Aspekte. Es sollen nur die Arbeiten zu TNF induzierten Signalwegen fortgesetzt werden.

数学模型von SignalTransduktionsProzessen and Analyst Dieser Modelle Kann im WechselSpiel MIT实验者Arbeit das Verständny Solcher Netzwerke nowm fördern。Bisher wurde das Bisher细节测试模型和信号传输到EGF erstellt。..。在Vorarbeiten aufsterellten modell Aus，von einem Extreme groçen，von uns in Vorarbeiten aufsterellten modell Aus，vere arbeiten auf dem gebiet der saumtischen Signalwege gingen ebenfall von einem extrem groçen，von uns in Vorarbeiten aufsterellten modell Aus.这是一种新型的热敏感症，它的实验数据和数据来自系统的半个部分，所有这些都是从卡斯卡德的角度出发的。Caspase-Kaskade Aus der Gesamtstruktur Exhiert的数学模型是严格的数学分析。在Forderung nach Bistablität des Systems Wiesen Diese Analyse auf De Notwendigkeit eines Regulatoren，Der Daraufhin din das Modeler Implementiert wurde(inwitzchen Wurden solche Regulatoren，die carps，auch in der Documatur chrieben)下。在Der Lage，Esentielle Zusammenhänge richtig zu bechreiben：Zum einen zeigte es sich Gegenüber Limitierter Initiator caspase-Aktivierung，D.H.这是一件非常重要的事情，因为它不会影响我们的生活。从现在起，每个人都能找到自己想要的东西。这是一项新的实验，它丰富了我们的生活和模型，因为它是一种新的、更广泛的和更广泛的信息。在接下来的文件中：1.Modelvaldierung and vergleichende Untersuhugen an unterterschiedlicheen zelltyen(Typ L BZW.Typ II)Durch EinzelzellExamente MIT Hilfe eines Enableten Systems der Mikroincektion 2.Erweterung des modells um den线粒体凋亡率Weg and Verknüpfung MIT einem Der文献命名者MODELL DER NF-KB-Signalwege 3.Etable iung eells Modelder Ligand/Rezeptor-Interaktion.从理论上讲，这是一种新的理论和方法。这是一种新型的肿瘤坏死因子治疗方法。