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Biogenesis and functions of aminocarboxypropyluridine in tRNA

tRNA 中氨基羧基丙基尿苷的生物发生和功能

基本信息

批准号：
21J10324
负责人：
高倉眞優子
金额：
$ 1.34万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-28 至 2023-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

今年度はヒトtRNAにおけるacp3U修飾の欠損がミトコンドリアの機能低下を引き起こす詳細な理由の解析を行った。まずは、acp3U修飾欠損株に修飾酵素を相補し、ミトコンドリアの機能が回復することを確認した。また修飾酵素の活性変異体については相補してもミトコンドリアの機能回復がみられないことが確認された。これによって実際にミトコンドリアの機能がacp3U修飾の欠損に起因することが示された。さらにRNA-seq解析によって、acp3U修飾欠損株においては野生株でコドンが最適化されているmRNA、すなわち通常時に翻訳速度の大きいmRNAの定常状態量が減少していることが判明した。実際にRNA-seq解析で発現量低下がみられたミトコンドリア関連のmRNAについてもコドンが最適化されたものであることが示された。したがってコドン最適化mRNAにおける翻訳の遅滞によりmRNAの分解が進むことで、ミトコンドリアの機能が低下するという機構が示唆された。さらに翻訳速度の異常はしばしばプロテオスタシスの異常を引き起こすが、acp3U修飾欠損時においても新生タンパク質の異常凝集率が上昇することが明らかとなった。またヒト骨格筋細胞の分化過程において、acp3U修飾率やacp3U修飾をもつtRNAの定常状態量がダイナミックに変動することを見出した。

This year's はヒトtRNA におけるacp3U modified のミトコンドリアのlow performance をinduced きrise こすな reason の analysis を row った.まずは, acp3U modification defective strain にmodification enzyme をphase complement し, ミトコンドリアのfunction がreply することをconfirmation した.またModification enzyme's active variant についてはphase complement してもミトコンドリアのfunction recovery がみられないことがconfirmされた.これによって実记にミトコンドリアの Function がacp3U Modified のdeficiency にcause することが Show された.さらにRNA-seq analysis によって, acp3U modification defective strain においては wild strain でコドンが optimization されていThe normal translation speed of るmRNA and すなわち is large, and the amount of constant state of いmRNA is reduced. The relationship between RNA-seq analysis and low clinical yield of RNA-seq analysisのmRNAについてもコドンがoptimizationされたものであることが Showされた. Optimal mRNA decompositionが入むことで、ミトコンドリアの Function is low and the mechanism is low and the mechanism is showing instigation. acp3U When the defect is repaired, the abnormal agglutination rate of the newly regenerated material will increase.またヒトbone lattice cell differentiation process において, acp3U modification rate やacp3U modification Decorated as をもつtRNA's constant state quantity がダイナミックに変动することを见出した.