日本産ヒキガエル属における交雑帯を介した種分化機構の解明
日本産ヒキガエル属における交雑帯を介した種分化機構の解明
批准号:
21J15839
负责人:
福谷 和美
金额:
$0.96万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-28 至 2023-03-31
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英文摘要
2022年度は、Mig-seq法により得られたSNPデータの解析を更に進めた。特に、亜種ニホンヒキガエルとアズマヒキガエル間には交雑帯が認められていたことから、その交雑帯の実態を調べることで、分類学的再検討につなげた。種ニホンヒキガエル155個体、ナガレヒキガエル13個体のシーケンスデータを用いた。まずシーケンスしたデータは、NCBIデータベースから取得した近縁種のゲノムデータに対してマッピングした後にジェノタイピングを行い、ジェノタイピング後のデータを用いて解析を行った。DAPC (discriminal analysis of principal components)、STRUCTURE解析、PCA(principal component analyses)の3つの検定に基づいて集団遺伝構造を推定した結果、ナガレヒキガエルの1クラスターを含む、5つのクラスターとなることが最適であることが推定された。種ニホンヒキガエル内では西日本に生息する亜種ニホンヒキガエル内と東日本に生息する亜種アズマヒキガエル内でそれぞれ2つの遺伝クラスターに分かれることが示唆された。次に、認められた種ニホンヒキガエル内の4つのクラスター間の交雑帯においてクライン解析を行った。その結果、分岐年代の古いクラスター間ほど、クラインの幅が狭く、交配に対する負の選択が強く存在する可能性が示唆された。特に、亜種ニホンヒキガエルとアズマヒキガエル間では遺伝的分化後の二次的接触が起きた年代を考慮すると、別種とみなすことができる程十分に交配に対する負の選択が存在することが示唆された。以上の結果は論文としてまとめ、国際誌への投稿の準備を進めている。
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会议论文
日本産ヒキガエル属の集団遺伝構造
日本蟾蜍属的群体遗传结构
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[福谷和美, 松井正文, 吉川夏彦, 西川完途]
通讯作者:
西川完途
DOI:
10.1016/j.parint.2022.102612
发表时间:
2022
期刊:
Parasitology International
影响因子:
1.9
作者:
[Marcaida Arvin Jet B., Nakao Minoru, Fukutani Kazumi, Nishikawa Kanto, Urabe Misako]
通讯作者:
Urabe Misako
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