Lumichrome biodegradation mechanism in Rhodococcus sp. LC-2.
Lumichrome biodegradation mechanism in Rhodococcus sp. LC-2.
批准号:
21K05357
负责人:
土肥 裕希
金额:
$2.66万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31
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英文摘要
リボフラビンは植物や微生物によって生産される水溶性ビタミンであり、自然界に広く存在する。生体から自然環境中に放出されたリボフラビンは光分解などを受けて容易にルミクロムとなるが、生じたルミクロムの環境動態は明らかにされていない。本研究では、ルミクロム分解能を有する放線菌Rhodococcus sp. LC-2株のルミクロム分解機構を解明することで、環境中におけるルミクロムの微生物分解経路を明らかにすることを目的としている。ルミクロム存在下で転写量が大きく上方制御された遺伝子クラスターにおいて、ルミクロムの分解代謝への関与が示唆された酵素タンパク質をコードした7つの遺伝子の遺伝子破壊株の作製にそれぞれ成功した。これら遺伝子破壊株のほとんどはルミクロム分解能を失ったことから、これらの遺伝子クラスターにコードされた酵素タンパク質がルミクロム分解に関与していることが明らかになった。LC-2株の全ゲノムDNA配列を明らかにした結果、上述の遺伝子クラスターは本菌株が有する線状プラスミドにコードされていたことが示された。このことは、LC-2株のルミクロム分解能がプラスミドによって後天的に獲得されたことを示唆しており、Rhodococcus属にルミクロム分解能が保存されていないという結果と一致した。LC-2株のルミクロム分解産物をHPLCおよびLC/MSによって解析した結果、ルミクロムの水酸化物と思われる化合物(分子量+16)が新たに検出された。さらに、当該化合物の分解産物を思われる化合物も検出されていることから、ルミクロム分解は水酸化反応を経て分解代謝されていく可能性を新たに見出した。
期刊论文(8)
专著(0)
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会议论文
微生物生態系におけるルミクロム分解機構の解明
阐明微生物生态系统中的发光色素分解机制
DOI:
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发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
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作者:
[出水庸介, 鈴木 麻菜美,前田 典歩,土肥 裕希,高谷 直樹]
通讯作者:
鈴木 麻菜美,前田 典歩,土肥 裕希,高谷 直樹
微生物生態系における細菌のリボフラビンおよびルミクロム分解
微生物生态系统中的细菌核黄素和发光色素降解
DOI:
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发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Katsuya Satoh, Shogo Ozawa, Hidenori Hayashi, Yutaka Oono, 富田 武郎, 西山 真, 河村麻衣子,三澤隆史,辻厳一郎,黒原崇,伊藤美千穂,出水庸介,花尻(木倉)瑠理, 土肥 裕希,鈴木 麻菜美,前田 典歩,尾崎 紗代子,高谷 直樹]
通讯作者:
土肥 裕希,鈴木 麻菜美,前田 典歩,尾崎 紗代子,高谷 直樹
土壌微生物生態系におけるリボフラビン動態
土壤微生物生态系统中核黄素动态
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[富田武郎, 西山真, 水谷佐久美,河村麻衣子,田中理恵,三澤隆史,辻厳一郎,黒原崇,伊藤美千穂,出水庸介,花尻(木倉)瑠理, 鈴木 麻菜美,前田 典歩,土肥 裕希,高谷 直樹]
通讯作者:
鈴木 麻菜美,前田 典歩,土肥 裕希,高谷 直樹
土壌細菌Ralstonia sp. XP-1株のキサントプテリン分解機構の解明
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批准号:24K08654
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.91万
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财政年份:2024
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负责人:土肥 裕希
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依托单位:
海外基金