藍色細菌生物時計分子装置の構造変化と時間発振の解明
藍色細菌生物時計分子装置の構造変化と時間発振の解明
批准号:
10J05904
负责人:
武藤 梨沙
金额:
$0.9万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2010
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2010 至 2011
中文摘要
藍色細菌は生物時計を持つ唯一の原核生物である。藍色細菌生物時計分子装置は時計タンパク質KaiA、KaiB、Kaicで構成されており、それらのタンパク質が複合体形成を変化させることで時計を刻んでいると考えている。タンパク質の複合体がいつ形成され、どこで相互作用するかを検証することで、生物時計を原子レベルで解明できる。私は、KaiBに注目し、KaiBとKaiAの相互作用部位を同定し、KaiBの構造変化について解析を行った。まず、KaiBにラジカルを持ったスピンラベル(MTSSL)を導入し電子スピン共鳴(ESR)法でKaiAやKaiCとの相互作用を調べた。スピンラベルを導入するためにCys残基導入KaiB変異体を25種類作製した。作製したKaiB変異体を精製し、それぞれにMTSSLを導入した。KaiAはC末端ドメインでKaiBと相互作用することがわかっている(Mutoh et al.,2010)。そこで準備したKaiB変異体のうち、18種類とKaiAのC末端ドメインタンパク質(KaiAc)と反応させたところ、2種類のKaiB変異体でESRスペクトルに大きな変化が認められた(KaiB_<E56c>、KaiB_<D57c>)。このうち、KaiB_<E56c>を用いてKaiA、KaiCと反応させたところ、KaiB-KaiA相互作用は反応開始後10時間目以降から起き始めることが分かった。次に、KaiBの構造変化について検証した。KaiBの2つの2量体境界面と表面にそれぞれMSLを導入したところ、4℃でのESRスペクトルには、速い成分と遅い成分の二成分が含まれ、スペクトルは4℃では24時間保温しても変化しなかったが、40℃で24時間保温すると速い成分に収束した。一方、KaiBの表面にラベルを導入した変異体では、4℃でも40℃でもスペクトルは変化しなかった。したがって、KaiBの構造は温度によって2量体境界面で大きく変化すると考えられた(Mutoh et al.,2011)。
英文摘要
藍色細菌は生物時計を持つ唯一の原核生物である。藍色細菌生物時計分子装置は時計タンパク質KaiA、KaiB、Kaicで構成されており、それらのタンパク質が複合体形成を変化させることで時計を刻んでいると考えている。タンパク質の複合体がいつ形成され、どこで相互作用するかを検証することで、生物時計を原子レベルで解明できる。私は、KaiBに注目し、KaiBとKaiAの相互作用部位を同定し、KaiBの構造変化について解析を行った。まず、KaiBにラジカルを持ったスピンラベル(MTSSL)を導入し電子スピン共鳴(ESR)法でKaiAやKaiCとの相互作用を調べた。スピンラベルを導入するためにCys残基導入KaiB変異体を25種類作製した。作製したKaiB変異体を精製し、それぞれにMTSSLを導入した。KaiAはC末端ドメインでKaiBと相互作用することがわかっている(Mutoh et al.,2010)。そこで準備したKaiB変異体のうち、18種類とKaiAのC末端ドメインタンパク質(KaiAc)と反応させたところ、2種類のKaiB変異体でESRスペクトルに大きな変化が認められた(KaiB_<E56c>、KaiB_<D57c>)。このうち、KaiB_<E56c>を用いてKaiA、KaiCと反応させたところ、KaiB-KaiA相互作用は反応開始後10時間目以降から起き始めることが分かった。次に、KaiBの構造変化について検証した。KaiBの2つの2量体境界面と表面にそれぞれMSLを導入したところ、4℃でのESRスペクトルには、速い成分と遅い成分の二成分が含まれ、スペクトルは4℃では24時間保温しても変化しなかったが、40℃で24時間保温すると速い成分に収束した。一方、KaiBの表面にラベルを導入した変異体では、4℃でも40℃でもスペクトルは変化しなかった。したがって、KaiBの構造は温度によって2量体境界面で大きく変化すると考えられた(Mutoh et al.,2011)。
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Nonselective excitation of pulsed ELDOR using multi-frequency microwaves
使用多频微波非选择性激发脉冲 ELDOR
DOI:
--
发表时间:
2011
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Asada, Y. Mutoh, R. Ishiura, M. and Mino H]
通讯作者:
M. and Mino H
Structural change of circadian clock protein KaiB
生物钟蛋白KaiB的结构变化
DOI:
--
发表时间:
2011
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Yuki Asada, Risa Mutoh, Masahiro Ishiura, Hiroyuki Mino, 武藤梨沙, 武藤梨沙, Risa Mutoh]
通讯作者:
Risa Mutoh
DOI:
10.1007/s00723-011-0228-2
发表时间:
2011-08-01
期刊:
APPLIED MAGNETIC RESONANCE
影响因子:
1
作者:
[Mutoh, Risa, Mino, Hiroyuki, Ishiura, Masahiro]
通讯作者:
Ishiura, Masahiro
Protein interactions in the in vitro cyanobacterial Kai clock system revealed by ESR analysis
ESR 分析揭示体外蓝藻 Kai 时钟系统中蛋白质相互作用
DOI:
--
发表时间:
2010
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Yuki Asada, Risa Mutoh, Masahiro Ishiura, Hiroyuki Mino, 武藤梨沙, 武藤梨沙, Risa Mutoh, 武藤梨沙, 武藤梨沙, 武藤梨沙]
通讯作者:
武藤梨沙
スピンラベル法による藍色細菌時計タンパク質間相互作用部位の同定と構造変化の解析
使用自旋标记鉴定蓝藻时钟蛋白之间的相互作用位点并分析结构变化
DOI:
--
发表时间:
2011
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Yuki Asada, Risa Mutoh, Masahiro Ishiura, Hiroyuki Mino, 武藤梨沙]
通讯作者:
武藤梨沙
共 11 条
ATP遊離リズムを新規指標とした生物時計の振動子の決定および機能部位の解析
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批准号:21K06117
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.66万
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财政年份:2021
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负责人:武藤 梨沙
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依托单位:
海外基金