Spatial regulation of chromosome organization in DNA double-strand break repair

DNA双链断裂修复中染色体组织的空间调控

基本信息

  • 批准号:
    21K06280
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.66万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 财政年份:
    2021
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2021-04-01 至 2024-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

DNA二本鎖切断 (double-strand breaks: DSB) は、染色体構造の不安定化を引き起こす要因となりうるため、染色体の動態制御はDSB修復に関与する相同組換え(homologous recombination: HR)経路のはたらきに必須の役割を果たしていると考えられる。SMC(structural maintenance of chromosomes)ファミリータンパク質は、染色体の凝縮・分配やDNA複製など、広範な染色体機能の制御に関与しており、近年、HR経路においても重要な役割を果たしていることが報告されている。本研究は、DNA損傷依存的に発現するSMCタンパク質であるRecNのDSB修復における役割を詳細に解析し、DNA鎖間の空間的制御とDSB修復促進のメカニズムを明らかにする。昨年までの研究から、MMC(マイトマイシンC)処理により核様体の断片化が観察されたrecN欠損細胞において、アラビノース誘導系を使ってRecNを発現させると、生存率および核様体構造が野生型レベルまで回復する現象を発見し、iRFN (induced reconstruction of fragmented nucleoids)と命名した。今年度は、これまでに実施したGFP-RecNを用いた細胞内局在の蛍光観察に加えて、RecA-mCherryまたはHU-mCherryとの共発現下における核様体構造の再構築過程を詳細に解析した。その結果、DAPIで染色されない断片化核様体のギャップ領域はDSBによって核様体ドメイン構造が壊れたことでDNAの統合性が失われた領域であることがわかった。さらに、RecA及びRecNはこのギャップ領域で共局在しており、RecAによるHR反応がRecNにより再活性化されることで核様体構造の再構築が起こることがわかった。
double-strand breaks (DSB) of DNA を, chromosomal construction <s:1> instability を causes <s:1> す due to とな <s:1> うるため うるため, dynamic control of chromosomal <s:1> <s:1> DSB repair に and する homologous recombination: HR professionals <s:1> たら に に に must strive to achieve を results た <s:1> て ると ると ると ると えられる examination えられる. SMC (structural maintenance of Chromosomes) フ ァ ミ リ ー タ ン パ ク qualitative は, chromosome condensation の distribution や DNA replication な ど, hiroo fan な chromosome function の suppression に masato and し て お り, in recent years, HR 経 に お い て も important な "を cut fruit た し て い る こ と が report さ れ て い る. は, DNA damage, this study dependent に 発 now す る SMC タ ン パ ク qualitative で あ る RecN の DSB repair に お け cut を る service detailed analytical し に の suppression of the space between, DNA lock と DSB repair promote の メ カ ニ ズ ム を Ming ら か に す る. Yesterday in ま で の research か ら, MMC (マ イ ト マ イ シ ン C) 処 Richard に よ り nuclear others body の fragment the が 観 examine さ れ た recN owe damaged cells に お い て, ア ラ ビ ノ ー ス induced を give っ て recN を 発 now さ せ る と, survival お よ び nuclear others structure が wild-type レ ベ ル ま reply で す る phenomenon を 発 し, iRFN (induced reconstruction of fragmented nucleoids)と named た. Our は, こ れ ま で に be applied し た GFP - RecN を with い た cells inside bureau in の 蛍 light 観 examine に plus え て, rec a mCherry ま た は HU - mCherry と の altogether 発 now に お け る nuclear の others in body structure to construct process detailed analytical し に を た. そ の results, DAPI で dyeing さ れ な い fragment the nuclear others body の ギ ャ ッ プ field は DSB に よ っ て nuclear others body ド メ イ ン tectonic が 壊 れ た こ と で DNA の valued materials が lost わ れ た field で あ る こ と が わ か っ た. さ ら に, rec a and び RecN は こ の ギ ャ ッ で プ field total bureau in し て お り, rec a に よ る HR anti 応 が RecN に よ り again activeness さ れ る こ と で nuclear の others in body structure to build が こ る こ と が わ か っ た.

项目成果

期刊论文数量(28)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
RecNによる核様体再構築メカニズムの解析
RecN分析类核重塑机制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    野田俊輔;仁木杏樹;毛谷村賢司;赤沼元気;菱田卓
  • 通讯作者:
    菱田卓
大腸菌RecNによる核様体の再構築と細胞内局在の観察
大肠杆菌RecN对类核重建和亚细胞定位的观察
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    野田俊輔;仁木杏樹;毛谷村賢司;赤沼元気;菱田卓
  • 通讯作者:
    菱田卓
DNA損傷ストレスに対する耐性機構がゲノム安定性に及ぼす影響
DNA损伤应激耐受机制对基因组稳定性的影响
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Akane Ohta;Atsushi Kuhara;菱田卓
  • 通讯作者:
    菱田卓
大腸菌SMC様タンパク質RecNによる断片化した核様体の再構築過程
大肠杆菌SMC样蛋白RecN对片段化核仁的重建过程
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    野田俊輔;仁木杏樹;毛谷村賢司;赤沼元気;菱田卓
  • 通讯作者:
    菱田卓
大腸菌RecNによる組換え反応促進機能の解析
大肠杆菌RecN促进重组反应功能分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    野田俊輔;赤沼元気;福間一史;桶谷浩之;毛谷村賢司;菱田卓
  • 通讯作者:
    菱田卓
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

菱田 卓其他文献

慢性低紫外線ストレス環境におけるDNA相同組換えの役割
DNA同源重组在慢性低紫外线胁迫环境中的作用
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Kiyomitsu;T.;菱田 卓
  • 通讯作者:
    菱田 卓
慢性的低線量率紫外線環境下におけるNER欠損株の損傷ストレス耐性メカニズムの解析
NER缺陷菌株慢性低剂量率紫外环境下损伤应激耐受机制分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    芝田 眞菜;毛谷村 賢司;菱田 卓
  • 通讯作者:
    菱田 卓
出芽酵母を用いたタウリン酸化キナーゼの同定とその解析
使用酿酒酵母鉴定和分析 tau 磷酸化激酶
  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    野田 俊輔;毛谷村 賢司;添田 義行;高島 明彦;菱田 卓
  • 通讯作者:
    菱田 卓
DNA二本鎖切断修復に関与するアセチル基転移酵素の機能解析
DNA双链断裂修复中乙酰转移酶的功能分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    田中 紫苑;毛谷村 賢司;菱田 卓
  • 通讯作者:
    菱田 卓
DNA二本鎖切断修復に関与する大腸菌RecNの変異体解析
参与 DNA 双链断裂修复的大肠杆菌 RecN 突变分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    桶谷 浩之;毛谷村 賢司;菱田 卓
  • 通讯作者:
    菱田 卓

菱田 卓的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('菱田 卓', 18)}}的其他基金

RecA-RecN共進化系を利用したタンパク質相互作用ドメインの探索と機能解析
使用 RecA-RecN 协同进化系统搜索和功能分析蛋白质相互作用域
  • 批准号:
    24K09330
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
DNA複製阻害からの回復に関わるDNA相同組換えと損傷トレランスのクロストーク
DNA同源重组与DNA复制抑制恢复中涉及的损伤耐受之间的串扰
  • 批准号:
    20055011
  • 财政年份:
    2008
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
環境破壊によって増大する発がんリスクとその分子メカニズム
环境破坏导致癌症风险增加及其分子机制
  • 批准号:
    20012030
  • 财政年份:
    2008
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
染色体恒常性維持における新規DNAモータータンパク質の機能
新型DNA马达蛋白在维持染色体稳态中的功能
  • 批准号:
    18058013
  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
SMC複合体によるDNA二重鎖切断に伴う染色体動熊制御機構の解析
SMC复合物与DNA双链断裂相关的染色体运动控制机制分析
  • 批准号:
    17687001
  • 财政年份:
    2005
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
DNA複製時におけるゲノム安定化維持機構の解析
DNA复制过程中基因组稳定维持机制分析
  • 批准号:
    14740411
  • 财政年份:
    2002
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
DNA複製時におけるゲノム安定化維持機構の解析
DNA复制过程中基因组稳定维持机制分析
  • 批准号:
    14026027
  • 财政年份:
    2002
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
遺伝的不安定性におけるADR遺伝子の関与
ADR 基因参与遗传不稳定性
  • 批准号:
    00J01466
  • 财政年份:
    2000
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows

相似海外基金

重粒子線照射後のDNA二本鎖切断修復における一本鎖アニーリング反応の解析
重离子束照射后DNA双链断裂修复过程中的单链退火反应分析
  • 批准号:
    24K10923
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
遺伝子領域に生じたDNA二本鎖切断の新規修復機構の解明
阐明遗传区域 DNA 双链断裂的新型修复机制
  • 批准号:
    24K15293
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
放射線誘発DNA二本鎖切断部位近傍における修復ナノドメインの構築原理と機能解明
阐明辐射诱导DNA双链断裂位点附近修复纳米结构域的构建原理和功能
  • 批准号:
    24K20933
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
新規DNA二本鎖切断修復関連タンパク質によるPARP阻害剤抵抗性メカニズムの解明
新型DNA双链断裂修复相关蛋白阐明PARP抑制剂耐药机制
  • 批准号:
    24K10173
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
電子線およびラジカルの粒子輸送シミュレーションによるDNA二本鎖切断誘導の解明
通过电子束和自由基粒子输运模拟阐明 DNA 双链断裂诱导
  • 批准号:
    22H04437
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
放射線誘発DNA二本鎖切断に応答する53BP1の超高解像度3次元動態解析
53BP1 响应辐射诱导 DNA 双链断裂的超高分辨率三维动态分析
  • 批准号:
    21K17888
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
重粒子線照射に特徴的なDNA二本鎖切断の修復機構の解析
重离子束辐照DNA双链断裂特征修复机制分析
  • 批准号:
    21K07658
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
RNAポリメラーゼIIのDNA二本鎖切断修復機構への関与の解明
阐明RNA聚合酶II参与DNA双链断裂修复机制
  • 批准号:
    20K19968
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
DNA二本鎖切断を誘導し、口腔癌の原因となる歯周病菌と病原因子の特定
牙周病细菌和诱导DNA双链断裂并导致口腔癌的致病因素的鉴定
  • 批准号:
    19K16647
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
イネいもち病菌におけるDNA二本鎖切断修復による進化機構の解明
阐明稻瘟菌DNA双链断裂修复的进化机制
  • 批准号:
    12J11224
  • 财政年份:
    2012
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了