メダカ科魚類における同所的種分化の遺伝基盤と浸透交雑による促進

青鳉鱼同域物种形成的遗传基础及渐渗杂交的促进

• 批准号: 21K06291
• 负责人: 柿岡 諒
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: University of the Ryukyus
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K06291/
• 关键词: 進化; 種分化; 適応; 交雑; 遺伝子流動; ゲノム; 魚類

動物が同所的に種分化するには資源分割と同類交配の成立が重要であると考えられている．しかし，それらがどのような遺伝的基盤にもとづいて進化したのか実証した研究はほとんどない．また，同所的種分化は系外からの遺伝子浸透があれば促進されうるという可能性は指摘されているものの，実証例はほとんどない．インドネシアのポソ湖で同所的に種分化したと考えられるメダカ科魚類を対象に，資源分割や同類交配に関わる形質がどのような遺伝的基盤を持っているのかを明らかにするために，量的遺伝子座位（QTL）解析を行った．本年度は，QTL解析に供するための飼育家系を育成し，試料の入手を行い，形質測定と，QTL解析に関する分子実験およびゲノムワイドSNPジェノタイピングを進め，QTL解析を開始した．その結果，餌資源利用や繁殖シグナルに関連する形質の種間差に関わるQTLを特定した．ポソ湖のメダカ科魚類野外集団における遺伝子浸透およびその同所的種分化における役割を明らかにするために，野外集団に関する集団ゲノム解析を進めた．本年度は，全ゲノムリシーケンシングデータを複数種から得るため，分子実験および全ゲノムシーケンシングを行った．得られたシーケンスデータを利用して解析を行い，現在種間で交雑が見られるか，種間での遺伝子流動の阻害が示唆される領域があるのか，逆に遺伝子流動が示唆される領域があるのかなどについて調べた．また，性決定に関連するゲノム領域をゲノムワイド関連解析で特定した．これらの結果について学会発表を行った．

Animal が homologous に species differentiation するに resource segmentation と homologous mating <s:1> establish が important であると studies えられて る る る る る る る. し か し, そ れ ら が ど の よ う な heritage 伝 base plate に も と づ い て evolution し た の か card be し た research は ほ と ん ど な い. ま た, with the kind of differentiation は extrasolar か ら の heritage 伝 child soak が あ れ ば promote さ れ う る と い う possibility は blame さ れ て い る も の の, be the example は ほ と ん ど な い. イ ン ド ネ シ ア の ポ ソ lake で に with the differentiation of し た と exam え ら れ る メ ダ カ secco fish を like に seaborne, resource division や mate に masato わ る character が ど の よ う な heritage 伝 base plate を hold っ て い る の か を Ming ら か に す る た め に, amount of heritage 伝 child seat (QTL) analysis line を っ た. This year は analytical に QTL for す る た め の breeding pedigree を bred し, sample line with の を い, character determination と, QTL parsing に masato す る molecular be 験 お よ び ゲ ノ ム ワ イ ド SNP ジ ェ ノ タ イ ピ ン グ を め, QTL parsing を start し た. そ の as a result, the resources use bait や breeding シ グ ナ ル に masato even す る character の interspecific difference に masato わ る QTL を specific し た. ポ ソ lake の メ ダ カ secco fish field set 団 に お け る heritage 伝 child soak お よ び そ の with the differentiation of に お け る "を cut Ming ら か に す る た め に, wild set 団 に masato す る set 団 ゲ ノ ム parsing を into め た. は this year, the entire ゲ ノ ム リ シ ー ケ ン シ ン グ デ ー タ を plural kinds of か ら have る た め, molecular be 験 お よ び full ゲ ノ ム シ ー ケ ン シ ン グ を line っ た. Have ら れ た シ ー ケ ン ス デ ー タ を using し て parsing を い, interspecific で now pay 雑 が see ら れ る か, interspecific で の heritage の 伝 son flow resistance against が in stopping さ れ る field が あ る の か, inverse に heritage 伝 son flow が in stopping さ れ る field が あ る の か な ど に つ い て adjustable べ た. Youdaoplaceholder0, sex determines に related するゲノム field をゲノムワ ド related analysis で specific た た. The results of れら を て て て learn to perform を.

项目成果

Speciation and phenotypic diversification of freshwater animals in ancient lake systems on Sulawesi, Wallace’s ‘anomalous island’

华莱士的“异常岛”苏拉威西岛古代湖泊系统中淡水动物的物种形成和表型多样化

• 发表时间: 2022
• 作者: Kakioka R;Yamahira K
• 通讯作者: Yamahira K

Resource partitioning is not coupled with assortative mating in sympatrically divergent ricefish in a Wallacean ancient lake

• DOI: 10.1111/jeb.13874
• 发表时间: 2021-06
• 期刊: Journal of Evolutionary Biology
• 影响因子: 2.1
• 作者: Ryo Kakioka;Nobu Sutra;Hirozumi Kobayashi;Satoshi Ansai;K. Masengi;A. Nagano;N. Okuda;Rieko Tanaka;M. Sato;K. Yamahira

インドネシア・ポソ湖で同所的に種分化したメダカ属魚類間でのゲノム分化

印度尼西亚波索湖同域物种形成的青鳉属鱼类的基因组分化。

• 发表时间: 2021
• 作者: 小林大純・山川宇宙・佐藤真央・前田 健・山平寿智;風間北斗;Yamamoto D.;瀬川 勝盛;柿岡諒・Masengi KWA・木村亮介・山平寿智
• 通讯作者: 柿岡諒・Masengi KWA・木村亮介・山平寿智

同所的なメダカ属魚類間における表現型分化の遺伝基盤とゲノム分化

青鳉属同域鱼类表型分化的遗传基础和基因组分化

• 发表时间: 2023
• 作者: 彦坂暁;彦坂-片山智恵;柿岡諒・安齋賢・田中理映子・佐藤正祐・北野潤・木村亮介・山平寿智
• 通讯作者: 柿岡諒・安齋賢・田中理映子・佐藤正祐・北野潤・木村亮介・山平寿智

インドネシア・ポソ湖で同所的種分化したメダカ属魚類におけるゲノム分化と遺伝子浸透

印度尼西亚波索湖青鳉鱼同域物种形成的基因组分化和基因渗透

• 发表时间: 2022
• 作者: Tuan Dat Le;Akihiro Tsuji;Yoshihiro H. Inoue;柿岡諒・K. W. A. Masengi・木村亮介・山平寿智
• 通讯作者: 柿岡諒・K. W. A. Masengi・木村亮介・山平寿智