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炎症性腸疾患における免疫細胞の分化可塑性の機序と病態の解明

阐明炎症性肠病免疫细胞分化可塑性的机制和病理学

基本信息

批准号：
21K07895
负责人：
村上真理
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K07895/
关键词：
炎症性腸疾患獲得免疫細胞シングルセル解析免疫細胞

项目摘要

T細胞の過剰な免疫応答は炎症性腸疾患の主たる誘因であるが、炎症性腸疾患特異的T細胞サブセットは今まで報告されていなかった。これまでの研究において我々はヒト腸管粘膜固有層T細胞を単一細胞レベルで包括的に解析することにより、炎症性の性質を有するクローン病特異的T細胞サブセットを同定した。本研究ではこれらの研究から得られた知見と手法をさらに発展させ、クローン病特異的T細胞サブセットの誘導を制御する上流の因子について明らかにすることを目的とする。クローン病患者の切除腸管病変部および大腸癌患者の非癌部（コントロール）の腸管粘膜固有層よりリンパ球を単離し、シングルセルRNA-seqおよびシングルセルATAC-seqを行った。まず、シングルセルRNA-seq解析より各サブセットにおける発現変動遺伝子を抽出し、得られた各細胞サブセットの遺伝子発現プロファイルの結果からこれまでの研究で見出したクローン病特異的T細胞サブセットに該当するサブセットを同定した。さらに同検体を用いて行ったシングルセルATAC-seqの結果から、クローン病特異的サブセットにおいて他のサブセットに比して有意に多く発現するオープンクロマチンモチーフを検出し、そこに結合する転写因子をランク付けするとともに、複数のバイオインフォマティクス解析を組み合わせることにより、クローン病特異的T細胞サブセットを制御すると考えられる候補転写因子を複数個絞り込んだ。これらの候補転写因子をin vitroの実験系でさらに絞り込む予定である。さらにシングルセルRNA-seqの結果より、この疾患特異的サブセットには腸内細菌由来の代謝物の受容体がきわめて特異的に発現することを見出した。

T-cell immune response T-cell immune response to T-cell immune response to T-cell immune response in patients with inflammatory diseases is reported today. In the study, we did some research on the inherent T cells in the mucous membrane of the tube, including the analysis of T cells and inflammatory diseases. The purpose of this study is to control the high-level factors in the treatment of the disease. To resect the tube disease, to remove the tube disease, to remove the non-cancer part of the large cancer patient, to treat the inherent mucous membrane of the tube, to isolate the ball, to remove the RNA-seq, to remove the ATAC-seq. The results of the RNA-seq analysis of the health care system and the health care unit showed that the health care unit was not affected by the disease. The results showed that the T-cell phone test was the same as that of the control group. In the same way, you can use the same system to determine the results of the ATAC-seq results, the results of the disease, the symptoms of the disease, the results, the results, the results and the results. The system is used to analyze the number of copies of the system. The system is used to analyze the system of the disease. Please write a factor of in vitro. This is the predetermined factor. The results of the RNA-seq test and the etiology of the bacteria in the disease-specific disease group showed that the bacteria came from the substitute, the recipient, the recipient and the recipient.

项目成果

期刊论文数量（5）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

包括的解析によりクローン病で同定された組織局在性T細胞サブセットの病態形成への役割

通过全面分析发病机制确定组织局部 T 细胞亚群在克罗恩病中的作用

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
村上真理;横井健人;竹田潔
通讯作者：
竹田潔

包括的解析によるヒト腸疾患の免疫プロファイリング

综合分析人类肠道疾病的免疫谱

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Ichise Eisuke;Chiyonobu Tomohiro;Ishikawa Mitsuru;Tanaka Yasuyoshi;Shibata Mami;Tozawa Takenori;Taura Yoshihiro;Yamashita Satoshi;Yoshida Michiko;Morimoto Masafumi;Higurashi Norimichi;Yamamoto Toshiyuki;Okano Hideyuki;Hirose Shinichi;村上真理
通讯作者：
村上真理

Deep profiling identifies a unique tissue resident CD4＋T-cell subset enriched in Crohn’s disease.

深度分析识别了克罗恩病中富含的独特组织驻留 CD4+T 细胞亚群。