ゲノム不安定性による体細胞モザイクを介したクローン病の発症・病態変化の解析

基因组不稳定导致体细胞嵌合介导的克罗恩病发病及病理变化分析

• 批准号: 21K07955
• 负责人: 角田 洋一
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Tohoku University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K07955/
• 关键词: クローン病; 染色体異常モザイク; チオプリン製剤; 体細胞モザイク変異; 染色体異常

LossやGainといった、染色体異常があるクローンが正常のクローンと混在している染色体異常モザイク（mCA）について、クローン病（CD）や潰瘍性大腸炎（UC）などの炎症性腸疾患（IBD）の患者においてどの程度発生しており、それがどのように病態にかかわっているか、さらには、薬剤などの影響でそのリスクが増幅されていないかなどを検討を進めた。これまで、大規模アレイ解析のデータをもとに解析を進め論文化を行った。論文発表にあたり、解析手法としての限界ともいえる問題が指摘された。アレイに設定されているマーカーの密度（マーカー間の距離）の問題から、全体として変異部位の同定はかなり荒い推定になってしまう。また、マーカー間の距離も部位によって大きく異なることから、推定された変異領域には大きなGapが存在している。そのため、これまでの解析で推定された領域は、その領域の機能的な予測には、かなりのずれを含んだ予測であり、信頼度が限定的である。そこで、今年度はモザイクのより正確な範囲および、染色体構造変異にとどまらないモザイクも把握できるよう、解析の設定をアレイから、全ゲノムシーケンス解析にシフトし、あらためて解析を開始した。並行して、アレイ解析で得られたデータをもとに、モザイク変異の有無が、疾患の罹患範囲などの病型との関連がないか、さらに発症年齢や重症度との関係がないかについて追加の解析を行った。その結果、いずれの表現型においてもモザイクとの関係はみとめられなかった。一方で、性染色体異常のモザイクが、健常人に比べて有意に多く、潜在的な性染色体異常のIBD発症への関連が示唆された。

LossやGainといった、chromosomal abnormalityがあるクローンがnormalのクローンとmixed inしている色Color body abnormality (mCA), colorectal disease (CD), ulcerative colitis (UC), inflammation Patients with sexual intestinal disorders (IBD) have different degrees of disease and disease.ているか, さらには, 薬剤などの affects でそのリスクが嗗 amplitude されていないかなどを検検を入めた.これまで、large-scale アレイanalyticsのデータをもとにanalyticsを进め文文文化を行った. The thesis table is clear, the analytical technique is limited, and the problem is pointed out. Problem with setting the density of アレイにされているマーカーの (distance between マーカーの)から、The whole thing is different parts of the same thing.また、によって大きくdifferent なることから、された変different area には大きなGapが existence しいる.そのため、これまでのANALYSISでESTIMATIONされた地は、その区のFUNCTIONなPredicted には, かなりのずれを contain んだpredicted であり, letter 頼degree が limited である.そこで、This year's はモザイクのより is correct な Fan囲および、The chromosome structure is different にとどまらないモザイクも is graspedきるよう, analytic setting をアレイから, 全ゲノムシーケンスanalytic にシフトし, あらためてanalytic をstart した. Parallel して, アレイanalytic でget られたデータをもとに, モザイク変different の有无が, disease の簹 sufferer 囲などのThe type of disease, the relationship between disease, age and severity of the disease, and the relationship between disease, additional analysis and analysis are added.そのRESULTS, いずれのphenomenon においてもモザイクとの Relationship はみとめられなかった. On the one hand, sex chromosome abnormalities are related to sex chromosome abnormality, and healthy people are more likely to have sex chromosome abnormalities than normal people, and potential sex chromosome abnormalities are related to IBD syndrome.